これは、オンライン Linux で実行する HomSI という名前の Linux アプリで、最新リリースは HomSI.zip としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
HomSI という名前のこのアプリをオンラインでダウンロードして実行し、OnWorks を使用して Linux でオンラインで無料で実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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Linux でオンラインで実行する HomSI
DESCRIPTION
血族家族では、両親から同じゲノムセグメントを受け継いだ結果、各個体はホモ接合性のゲノムを長く持ちます。 この状況は、これらの家族のメンバーの間で劣性疾患の蔓延につながります。 ホモ接合性マッピングはこの観察に基づいており、この技術を利用して血族家系でいくつかの劣性疾患遺伝子が発見されています。 研究者は通常、SNP アレイを使用してホモ接合領域を決定し、この候補疾患遺伝子座内の遺伝子を配列決定して疾患遺伝子を検索します。 最近、次世代シーケンスの出現により、単一のシーケンス実験からのデータを使用して、ホモ接合領域の同定と診断に関連する変異の検出を同時に行うことが可能になりました。 この点で、我々は深配列データを使用してホモ接合領域を同定する新しいツールを開発しました。 *.vcf ファイルを入力ファイルとして使用して、プログラムは主要なファイルを識別します。オプション
- NGS データのホモ接合性マッピング
ユーザーインターフェース
Java SWT
プログラミング言語
Java
これは、https://sourceforge.net/projects/homsi/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
