これは、Just_Preprocess_My_Readsという名前のLinuxアプリであり、最新リリースはjustpreprocessmyreads_Aug2015c.tar.gzとしてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティングプロバイダーOnWorksでオンラインで実行できます。
Just_Preprocess_My_Readsという名前のこのアプリをOnWorksで無料でダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
Just_Preprocess_My_Reads
Ad
DESCRIPTION
rRNA、コンタミネーション、標準的な方法でのトリムなどを識別します。読み取りペアを維持します。 ファイアアンドフォーゲットのハイスループットプロジェクト（テラバイトのデータ）用に構築されています。
pbzip2、bowtie2、fastx_toolkit、samtools、fastqc、Trimmomatic（オプション）を使用します
特徴
- イルミナの前処理
- 汚染チェック
Audience
科学/研究
カテゴリー
これは、https：//sourceforge.net/projects/justpreprocessmyreads/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
