これは、オンラインの Linux で実行する lr2rmats という名前の Linux アプリで、最新リリースは lr2rmats-v0.1-alpha.tar.gz としてダウンロードできます。ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
lr2rmats という名前のこのアプリをオンラインでダウンロードして実行し、OnWorks を使用して Linux でオンラインで無料で実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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Linux でオンラインで実行する lr2rmats
DESCRIPTION
lr2rmats は Snakemake ベースの軽量パイプラインで、第 XNUMX 世代のロングリードと第 XNUMX 世代のショートリード RNA-seq データの両方を利用して強化された遺伝子アノテーション ファイルを生成するように設計されています。 新しく生成されたアノテーション ファイルは、差分選択スプライシング解析のために rMATS に提供できます。より多くの情報はで見つけることができます https://sourceforge.net/p/lr2rmats/wiki/Home/
オプション
- 長い間読んだ
- RNA シーケンス
- 交互接続
- 太平洋バイオサイエンス
- オックスフォードナノポアテクノロジーズ
Audience
科学/研究
ユーザーインターフェース
コマンドライン
プログラミング言語
Unixシェル、Python、C
これは、https://sourceforge.net/projects/lr2rmats/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
