これは、最新リリースをmiRDP2-v2.tar.gzとしてダウンロードできるLinuxオンラインで実行するmiRDP1.1.4という名前のLinuxアプリです。 ワークステーション用の無料ホスティングプロバイダーOnWorksでオンラインで実行できます。
miRDP2という名前のこのアプリをダウンロードしてオンラインで実行し、OnWorksを使用してLinuxでオンラインで無料で実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
Linuxオンラインで実行するmiRDP2
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DESCRIPTION
miRDeep-P2（miRDP2）は、植物のマイクロRNA（miRNA）トランスクリプトームを正確かつ迅速に分析するために開発されました。 これは、miRDeep-P（miRDP）から採用され、新しい戦略とオーバーホールされたアルゴリズムを備えています。 シロイヌナズナ、イネ、トマト、トウモロコシ、小麦など、ゲノムサイズが徐々に大きくなっている植物のmiRNAトランスクリプトームを分析するためにmiRDP2をテストしました。 miRDeep-Pや他のいくつかの計算ツールと比較して、miRDP2はNGSデータを優れた速度で処理しました。 新しく更新された植物miRNAアノテーション基準を組み込むことにより、miRDP2の精度も大幅に向上します。 私たちの結果は、miRDP2が植物のmiRNAトランスクリプトームを分析するための高速で正確なツールであることを示しています。参考文献・引用元 https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty972
オプション
- 低分子RNA
- microRNA（miRNA）
- 次世代シーケンシング（NGS）
- パール
Audience
科学/研究
プログラミング言語
パール
データベース環境
Perl DBI / DBD
これは、https：//sourceforge.net/projects/mirdp2/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
