これは、Linux でオンラインで実行する NGS ツール用の Pipeline Builder という名前の Linux アプリで、最新リリースは Pipeline_builder_20150106-1044-build-baf32e1.tar.gz としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
Pipeline Builder という名前の NGS ツール用アプリをオンラインでダウンロードして実行し、OnWorks を使用して Linux でオンラインで無料で実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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Linux でオンラインで実行する NGS ツール用のパイプライン ビルダー
DESCRIPTION
NGS ツール構成ファイルの処理は、現代の生物学者やバイオテクノロジー者にとって大きな課題です。 生産性、具体性を高め、データ処理を強化するために、このツールはすでに構造化されたコマンドのコレクションを提供し、ユーザーが分析するデータに適したパイプラインを構築できるようにします。Pipeline Builder は、複雑な NGS 分析パイプラインを管理するためのスクリプト ツールです。 これは、ユーザーが NGS ツール コマンドを作成したり、独自の分析パイプラインを作成したりするのに役立ちます。 これにより、データに依存しない再現可能な分析が可能になり、変数のエクスポートを通じてデータと結果を分離する保護された環境を作成できます。 これは、ウィザード メニューとステップバイステップのチュートリアルを備えたコマンド ライン ツールとして提供されます。
Pipeline Builder は Perl で書かれており、クロスプラットフォームです。
特徴
- NGSパイプラインの構築
- NGS ツールの並列呼び出し
- 重複や冗長性を持たずにデータを保存
Audience
科学/研究
ユーザーインターフェース
コマンドライン
プログラミング言語
パール
これは、https://sourceforge.net/projects/pipelinebuilder/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
