これは、Linux オンラインで実行する PolyCTLDesigner という名前の Linux アプリで、その最新リリースは dist_PolyCTLDesigner.0.3.a.zip としてダウンロードできます。 これは、ワークステーション用の無料のホスティング プロバイダーである OnWorks でオンラインで実行できます。
PolyCTLDesigner という名前のこのアプリをダウンロードしてオンラインで実行し、OnWorks を使用して Linux オンラインで無料で実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
Linux オンラインで実行する PolyCTLDesigner
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DESCRIPTION
ペプチド（T細胞エピトープ）が与えられると、PolyCTLDesignerは隣接配列を選択してTAP結合を最適化し、プロテアソームおよび/または免疫プロテアソームプロセシングによる潜在的なエピトープの効率的な遊離を提供し、接合エピトープの数を最小限に抑える方法で、得られたオリゴペプチドをポリエピトープに結合します。 ポリエピトープを構築するために、PolyCTLDesignerはプロテアソーム切断とTAP結合特異性の既知のアミノ酸パターンを利用します。 PolyCTLDesignerは、選択したHLAレパートリーをカバーする抗原ペプチドを希望の冗長率で選択することもできます。 抗原配列が与えられると、PolyCTLDesignerはTヘルパーエピトープを選択することもできます。 T細胞エピトープを予測するために、TEpredictを使用します。Audience
科学/研究
プログラミング言語
Python
これは、https：//sourceforge.net/projects/polyctldesigner/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
