これは、最新リリースをPontos-3.0.jarとしてダウンロードできるLinuxオンラインで実行するPontosという名前のLinuxアプリです。 ワークステーション用の無料ホスティングプロバイダーOnWorksでオンラインで実行できます。
このPontosという名前のアプリをダウンロードしてオンラインで実行し、OnWorksを使用してLinuxでオンラインで無料で実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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Linuxオンラインで実行するPontos
DESCRIPTION
Pontosは、PHYLIP形式のDNA配列アラインメントから未修正の距離（または類似性）行列を計算するための使いやすいグラフィカルJavaプログラムです。 また、通常のアラインメントとは「異なる」アラインメントを作成します（その逆も同様です）。さまざまな方法でギャップとあいまいさを処理できます。
ギャップは次のようになります。
-すべて使用済み。
-すべて無視されます。
-ペアごとに、シーケンスの最後でのみ無視されます。
-端でのみ無視されますが、現在はグローバルに無視されます（実際には、アラインメント全体を端から最も遠い配列にトリミングします）。
あいまいさ（DNAシーケンスのR、Y、N、Wなど）は次のように扱うことができます。
-あいまいさは常に異なるものと見なします。
-あいまいさを部分的に異なるものと見なします（たとえば、RはAまたはGと0.5異なる）。
-各ペアワイズ比較のあいまいさを無視します。
-あいまいさを示すすべての列をグローバルに削除します。
PontosはLinuxで作成されましたが、Javaが機能するすべてのシステムで実行する必要があります。 PontosはGPLバージョン3の下でライセンスされています。
Audience
科学/研究、エンドユーザー/デスクトップ
ユーザーインターフェース
Java Swing
プログラミング言語
Java
これは、https：//sourceforge.net/projects/pontos/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
