これはLinuxでオンラインで実行できるPower DecoderというLinuxアプリケーションです。最新リリースはPowerDecoder-1.0.0.tar.gzとしてダウンロードできます。ワークステーション向けの無料ホスティングプロバイダーであるOnWorksでオンラインで実行できます。
Power Decoder というこのアプリをオンラインでダウンロードして実行すると、OnWorks を使用して Linux で無料でオンラインで実行できます。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
Linux でオンラインで実行できる Power Decoder
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DESCRIPTION
プールされたショートヘアピン（sh）RNAを使用したRNA干渉（RNAi）スクリーニングは、表現型に対する遺伝子の生物学的関連性を判断するための強力なハイスループットツールです。 shRNAプールスクリーンのパフォーマンスを評価することは実際には困難です。 再現性を電力の代用として使用するか、検証済みのポジティブコントロールとネガティブコントロールを多数使用することによってのみ、パフォーマンスを見積もることができます。 ここでは、スクリーンの統計的検出力を推定するために使用できるインシリコでshRNAプールスクリーニング実験を生成するためのオープンソースソフトウェアツールであるPowerDecoderシミュレーターを開発します。 負の二項分布を使用して、単一のスクリーニング複製内の複数のshRNAの相対的な存在量と、個々のshRNAごとの複製間の生物学的ノイズの両方をモデル化します。 PowerDecoderシミュレーターはRとPythonで書かれています。ユーザーインターフェース
コンソール/ターミナル
これは、https：//sourceforge.net/projects/powerdecoder/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
