これは PyBrella という名前の Linux アプリで、最新リリースは pybrella.py としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
PyBrella という名前のこのアプリを OnWorks で無料でオンラインでダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
パイブレラ
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DESCRIPTION
PyBrellaは、AMBER分子動力学パッケージを使用してアンブレラサンプリングプロセスを自動化するように設計されたスクリプトです。
オプション
- ユーザー定義の開始点と終了点を使用して、距離パラメーターでのアンブレラサンプリングのMD実行のセットアップと実行を自動化します。
- 80/20カイXNUMX乗距離法に基づいてサンプル収束の確認を実行します。
- サンプルのヒストグラムを調べ、指定されたサンプリングしきい値に到達するために必要な場合は自動的に新しいサンプルを開始します。
Audience
科学/研究
プログラミング言語
Python
カテゴリー
これは、https：//sourceforge.net/projects/pybrella/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
