これは、オンライン Linux で実行する RGAAT という名前の Linux アプリで、最新リリースは RGAAT.tar.gz としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
RGAAT という名前のこのアプリをオンラインでダウンロードして実行し、OnWorks を使用して Linux でオンラインで無料で実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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Linux でオンラインで実行する RGAAT
DESCRIPTION
このプログラムは、シーケンスアラインメントファイル（SAMまたはBAM形式）、シーケンスバリアントファイル（VCF形式または3つのコロムテーブル（染色体、位置、ID、参照を含むタブ区切り）を使用して、新しいゲノムおよび既知のゲノムアップグレードのためにゲノムをアセンブルおよび/または注釈を付けることができますアレルおよび代替アレル））またはリファレンスゲノムシーケンスファイル（FASTAフォーマット）およびアノテーションファイル（TBL、GTF、GFF、GFFXNUMXまたはBEDフォーマット）に基づく新しいゲノムシーケンスファイル（FASTAフォーマット）。オプション
- 配列変異の同定
- ゲノムコンセンサス配列の構築
- ゲノム修飾
- ゲノム比較
- ゲノム注釈
- 異なるゲノムアセンブリバージョン間のゲノム座標変換の構築
Audience
科学/研究
プログラミング言語
パール
これは、https：//sourceforge.net/projects/rgaat/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
