これは、Linuxでオンラインで実行できるRNASeq-MATSというLinuxアプリケーションです。最新リリースはtestData.tgzとしてダウンロードできます。ワークステーション向けの無料ホスティングプロバイダーであるOnWorksでオンラインで実行できます。
RNASeq-MATS というこのアプリをオンラインでダウンロードして実行すると、OnWorks を使用して Linux で無料でオンラインで実行できます。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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Linuxでオンライン実行するRNASeq-MATS
DESCRIPTION
MATSは、RNA-Seqデータから選択的スプライシングイベントの差異を検出するための計算ツールです。 MATSの統計モデルは、XNUMXつの条件間の遺伝子のアイソフォーム比の差が特定のユーザー定義のしきい値を超えるというP値と偽発見率を計算します。 RNA-Seqデータから、MATSは、すべての主要なタイプの選択的スプライシングパターンに対応する選択的スプライシングイベントを自動的に検出および分析できます。 MATSは、ペアの研究デザインとペアのない研究デザインの両方からの複製RNA-Seqデータを処理します。 詳細については、次のURLをご覧ください。 http://rnaseq-mats.sourceforge.net.これは、https：//sourceforge.net/projects/rnaseq-mats/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
