これは、オンライン Linux で実行する SAMSVM という名前の Linux アプリで、最新リリースは SAMSVMv1.01.rar としてダウンロードできます。ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
SAMSVM という名前のこのアプリをオンラインでダウンロードして実行し、OnWorks を使用して Linux でオンラインで無料で実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
Linux でオンラインで実行する SAMSVM
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DESCRIPTION
サポート ベクター マシンのパッケージである LIBSVM を適用して、SAMSVM は、SAM フォーマットのミスアライメントされた読み取りを正しく検出してフィルタリングするために開発されました。 このようなフィルタリングにより、アライメントおよび次のバリアント分析における偽陽性を減らすことができます。オプション
- C + +
- bwa と samtools が必要です
Audience
科学/研究
ユーザーインターフェース
コマンドライン
プログラミング言語
C + +
データベース環境
フラットファイル
これは、https://sourceforge.net/projects/samsvm/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
