これはsgRNAcas9という名前のLinuxアプリで、最新リリースはsgRNAcas9_3.0.5.zipとしてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティングプロバイダーOnWorksでオンラインで実行できます。
OnWorksでsgRNAcas9という名前のこのアプリを無料でダウンロードしてオンラインで実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
スクリーンショットは
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sgRNAcas9
DESCRIPTION
このパッケージは、ユーザー定義のパラメーターを使用してCRISPRターゲットサイト（プロトスペーサー）の検索を実行し、ゲノム全体のCas9の潜在的なオフターゲット切断サイト（POT）を予測し、POTを20つのカテゴリに分類し、7を構築するためのオリゴヌクレオチドをバッチ設計するプログラムで構成されています。 -nt（ヌクレオチド）またはトランケートされたsgRNA発現ベクターは、T1E9切断アッセイによって変異を検証するためのPCRプライマーペアを設計するために、オンターゲットまたはオフターゲット切断部位に隣接する目的の長さのヌクレオチド配列を抽出します。 重要なことに、インシリコで潜在的なオフターゲットサイトを特定することにより、sgRNAcasXNUMXはより具体的なターゲットサイトの選択を可能にし、真正なオフターゲットサイトの特定を支援し、ゲノム編集アプリケーション用のsgRNAの設計を大幅に促進します。引用：Xie S、ShenB、Zhang C、Huang X、Zhang Y. sgRNAcas9：CRISPR sgRNAを設計し、潜在的なオフターゲット切断部位を評価するためのソフトウェアパッケージ。 PLoSOne。 2014,9（6）：e100448。
http://www.biootools.com/
これは、https：//sourceforge.net/projects/sgrnacas9/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。
