これは Linux オンラインで実行するための SpiKeDeteKt という Linux アプリで、最新リリースは SpikeDetekt0.1.2.tar.gz としてダウンロードできます。ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
SpiKeDeteKt というこのアプリをオンラインでダウンロードして実行すると、OnWorks を使用して Linux で無料でオンラインで実行できます。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
SpiKeDeteKt が Linux でオンラインで実行可能に
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DESCRIPTION
これは、プローブの形状を考慮して、新しいマスクされたバージョンの KlustaKwik で使用される .mask ファイルを生成する自動スパイク検出プログラムです。Python 2.6 または 2.7 を使用することをお勧めします。たとえば、無料のアカデミック バージョンは Entthought Python から入手できます。
SpiKeDeteKt の入力ファイルは次のとおりです。
.dat (生データ ファイル)
.probe (プローブ ファイル、以下で説明 - ユーザーが作成)
parameters.py (オプション - それ以外の場合は、defaultparameters.py が使用されます)
SpiKeDeteKt は次のファイルを出力します。
.fet.n (機能ファイル)
.mask.n (新しい (マスクされた) KlustaKwik を使用するために必要)
.clu.n (すべてが XNUMX つのクラスターにまとめられた簡単な手がかりファイル)
.fmask.n (トライアル - バイナリの代わりに浮動小数点マスク。マスクされた KlustaKwik をテストするためにこれを使用しています)
.spk.n (スパイク ファイル)
上n (フィルタされていないスパイク波形)
.res.n (スパイク時間のリスト)
.xml (後でニューロスコープまたはクラスタで使用できるすべてのパラメータを含む XML ファイル)
.fil (ハイパスフィルター処理されたデータ)
.h5 (
Audience
科学/研究
プログラミング言語
Python
これは、https://sourceforge.net/projects/spikedetekt/ から取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティング システムの XNUMX つから最も簡単な方法でオンラインで実行できるように、OnWorks でホストされています。
