これは、オンライン Linux 上で Windows オンラインで実行する Microarray 関連モチーフ アナライザーという名前の Windows アプリで、最新リリースは MAMA_latest.zip としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
Microarray 関連モチーフ アナライザーという名前のこのアプリをオンラインでダウンロードして実行すると、OnWorks を使用してオンライン Linux 上で Windows オンラインで無料で実行できます。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOSOnWorksオンラインエミュレーターを起動しますが、Windowsオンラインエミュレーターの方が優れています。
-5。起動したばかりのOnWorksWindows OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードしてインストールします。
-7.LinuxディストリビューションソフトウェアリポジトリからWineをダウンロードします。 インストールしたら、アプリをダブルクリックして、Wineで実行できます。 また、人気のあるWindowsプログラムやゲームのインストールに役立つWine上の豪華なインターフェイスであるPlayOnLinuxを試すこともできます。
WineはLinux上でWindowsソフトウェアを実行する方法ですが、Windowsは必要ありません。 Wineは、任意のLinuxデスクトップでWindowsプログラムを直接実行できるオープンソースのWindows互換性レイヤーです。 基本的に、Wineは、実際にWindowsを必要とせずに、これらすべてのWindowsアプリケーションを実行できるように、十分な数のWindowsを最初から再実装しようとしています。
Linux オンライン上で Windows オンラインで実行するマイクロアレイ関連モチーフ アナライザー
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DESCRIPTION
マイクロアレイ分析における加重配列類似性と遺伝子発現プロファイルに基づいて、新しいシス作用要素を予測するために、新しいクラスタリングフリーの方法であるマイクロアレイ関連モチーフアナライザー(MAMA)を開発しました。 遺伝子発現のシミュレーションは、サポートベクターマシンを使用して、予測されたモチーフとモチーフペアの存在に基づいて実行されました。 シミュレートされた遺伝子発現の精度を使用して、予測の品質を評価し、この方法で使用されるパラメーターを最適化しました。 最適化後、MAMAは遺伝子発現の87%以上を正確にシミュレートしました。Kakei Y、Ogo Y、Itai RN、etal。を参照してください。 (2013)鉄欠乏におけるシスエレメントペアの協調機能を仮定するためのシスエレメントの新しい予測方法の開発。 ライス6(1):22。
Audience
科学/研究
ユーザーインターフェース
コマンドライン
プログラミング言語
Python、Perl、C
これは、https://sourceforge.net/projects/microarray-motif-analyzer/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。