Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 실행할 수 있는 bp_revtrans-motifp 명령입니다.
프로그램:
이름
bp_revtrans-motif - Profam 유사 단백질 모티프를 역번역합니다.
버전
버전 0.01
개요
파일에서:
bp_revtrans-motif.pl -i 모티브.txt
파이프 사용:
bp_revtrans-motif.pl < 모티프.txt > 출력.txt
명령 프롬프트에서 대화형으로 사용:
$ bp_revtrans-모티프.pl
마에엘[VIKP]
1. ATGGCNGCNGARGARYTNVHN
[^P]H(IW){2,3}
2. NDNCAY(ATHTGG){2,3}
기술
이 스크립트는 단백질 모티프를 입력으로 사용하고 축퇴성 올리고뉴클레오티드를 반환합니다.
그에 해당하는 순서입니다. 이렇게 하는 주된 이유는 타락한 디자인을 하기 위해서입니다.
주어진 서열 패턴을 증폭시키는 프라이머.
입력 모티프는 다음 중 하나를 포함하는 한 글자 잔기의 문자열로 구성됩니다.
구문 요소:
[...] : 중복 위치.
하나 이상의 잔여물이 허용되는 위치입니다. 예:
[TS]YW[RKSD]
^^^^^^
[^...] : 부정된 입장.
잔여물이 허용되는 위치로 괄호 안에 저장됩니다. 예:
[^PW]MK[LAE]
^^
(...){n,m,...} : 반복되는 모티브.
반복되는 모티브 n or m 타임스. 이전 구문 중 하나를 가질 수 있습니다.
강요. 예:
A[SN]C(TXX){2,4,8}
^^^
허용되는 문자는 20가지 천연 아미노산에 해당하는 문자와 다음 항목입니다.
비 = 엔 + 디
지 = Q + 전자
X = 모두
옵션
-i 입력 파일:
역번역할 모티브 목록이 포함된 파일입니다.
-h
이 도움말 메시지를 표시합니다.
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 bp_revtrans-motifp를 사용하세요.
