Ubuntu Online, Fedora Online, Windows ์จ๋ผ์ธ ์๋ฎฌ๋ ์ดํฐ ๋๋ MAC OS ์จ๋ผ์ธ ์๋ฎฌ๋ ์ดํฐ์ ๊ฐ์ ์ฌ๋ฌ ๋ฌด๋ฃ ์จ๋ผ์ธ ์ํฌ์คํ ์ด์ ์ค ํ๋๋ฅผ ์ฌ์ฉํ์ฌ OnWorks ๋ฌด๋ฃ ํธ์คํ ๊ณต๊ธ์์์ ์คํํ ์ ์๋ bp_run_neighbor.plp ๋ช ๋ น์ ๋๋ค.
ํ๋ก๊ทธ๋จ:
์ด๋ฆ
run_neighbor - Bioperl์ ํตํด Phylip์ 'neighbor' ํ๋ก๊ทธ๋จ ์คํ
๊ฐ์
run_neighbor [-i ์ ๋ ฅํ์ผ] [-o ์ถ๋ ฅํ์ผ์ด๋ฆ]
๊ธฐ์
๋ค์ด๋ฒ๋ฅผ ์คํํ ๋งคํธ๋ฆญ์ค ํ์ผ์ ์ ๊ณตํฉ๋๋ค. ํ์ผ ์ด๋ฆ์ file.matrix ํ์์ด์ด์ผ ํฉ๋๋ค.
๋๋ file.protdist(๋์ ์ค์ํ์ง ์์ง๋ง ํ๋ก๊ทธ๋จ์
(\S+)\.(\S+).
๊ทธ๋ฌ๋ฉด 'neighbor' ์ ํ๋ฆฌ์ผ์ด์ ์ ์คํํ์ฌ ๋จ๋ฐฑ์ง์์ Neighbor-Joining ํธ๋ฆฌ๋ฅผ ๊ตฌ์ถํฉ๋๋ค.
๊ฑฐ๋ฆฌ ํ๋ ฌ.
onworks.net ์๋น์ค๋ฅผ ์ฌ์ฉํ์ฌ bp_run_neighbor.plp ์จ๋ผ์ธ ์ฌ์ฉ