이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 실행할 수 있는 명령 요약입니다.
프로그램:
이름
다이제스트 - 단백질 단백질 분해 효소 또는 시약 절단 부위에 대한 보고서
개요
요람 -seqall 시퀄 -mw데이터 데이터 파일 -메뉴 명부 -단 핵증 부울 - 불리한 부울
-야유 부울 -터미널 명부 -겹침 부울 -전체 부분 부울
-아웃파일 신고
요람 -도움
기술
요람 EMBOSS("유럽 분자 생물학 오픈"의 명령줄 프로그램입니다.
소프트웨어 제품군”). "Protein:Motifs" 명령 그룹의 일부입니다.
옵션
입력 섹션에 있어야 합니다.
-seqall 시퀄
-mw데이터 데이터 파일
아미노산의 분자량 데이터 기본값: Emolwt.dat
필수 섹션에 있어야 합니다.
-메뉴 명부
기본값: 1
-단 핵증 부울
기본값: N
Advnaced 섹션에 있어야 합니다.
- 불리한 부울
트립신은 일반적으로 'KRIFLP' 다음에 오는 경우 'KR' 다음에 절단되지 않습니다.
Lys-C는 일반적으로 'P' 다음에 오면 'K' 다음에 잘리지 않습니다. Arg-C는
일반적으로 'P' 다음에 오는 경우 'R' 다음에 잘립니다. V8-bicarb는 일반적으로 다음 후 절단되지 않습니다
뒤에 'KREP' 중 하나가 오는 경우 'E'입니다. V8-phosph는 다음과 같은 경우 'DE' 후에 일반적으로 절단되지 않습니다.
그 뒤에 'P'가 붙습니다. 키모트립신은 다음과 같은 경우 'FYWLM' 이후에 정상적으로 절단되지 않습니다.
뒤에 'P'가 붙는다. unfavored를 지정하면 이러한 unfavored 컷과
선호하는 것들.
-야유 부울
반특이적 및 비특이적 소화를 허용합니다. 이 옵션은 특히 유용합니다.
다음을 사용하여 단백질 식별을 위한 펩타이드 서열 목록 생성
질량 분석.
-터미널 명부
기본값: 1
산출 섹션에 있어야 합니다.
-겹침 부울
부분 소화에 사용됩니다. 선호하는 컷 사이트의 모든 컷과 1..3, 2..4,
3..5 등(예: 아님) 2..5. 따라서 겹침은 정확히 하나의 조각입니다.
그 안에 잠재적인 절단 사이트.
-전체 부분 부울
겹침의 경우 둘 이상의 잠재적 절단 부위를 포함하는 단편이 포함됩니다.
-아웃파일 신고
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인 다이제스트 사용
