이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 공급자에서 실행할 수 있는 fa2dna 명령입니다.
프로그램:
이름
fa2dna - ANFO와 함께 사용할 fasta 데이터베이스 형식 지정
개요
fa2dna [ 선택권 | 파일 ... ]
기술
fa2dna 하나 이상의 파일을 fast 형식으로 읽고 적합한 데이터베이스로 다시 포맷합니다.
for 안포(1). 입력 파일은 둘 이상의 시퀀스를 포함할 수 있으며 각 시퀀스는
Ns의 스트레치에 의해 여러 contig로 나뉩니다. 모든 IUPAC 모호성 코드는
완벽하게 지원됩니다.
옵션
-V,-버전
버전 번호를 인쇄하고 종료합니다.
-o 파일, --출력 파일
에 출력 쓰기 파일.파일 로 끝나야 한다 .dna, 때문에 안포 그리고 일부 다운스트림
도구가 다른 확장을 우연히 발견할 수 있습니다. 기본값은 다음과 같은 게놈 이름입니다.
전에, .dna 확대.
-m N, --maxn N
최대 수를 설정합니다. Ns는 IUPAC 모호성 코드로 해석됩니다. N; 어느
더 긴 스트레치는 contig를 분리하는 것으로 해석됩니다. 기본값은 2입니다.
-g 이름, --게놈 이름
게놈 이름을 다음으로 설정합니다. name. 이 이름은 출력 파일에 저장되며
에 의해 사용되는 안포 출력에서 일치하는 게놈을 식별합니다. 게놈은 다음과 같아야 합니다.
다운스트림 도구에서 찾을 수 있도록 출력 파일 이름의 접두사. 이름
인간이나 침팬지의 경우 "hg18" 또는 "pt2"와 같이 짧지만 고유해야 합니다.
게놈은 잘 작동할 것입니다.
-d 텍스트, --설명 텍스트
추가 본문 메타데이터에 대한 설명으로. 이것은 순전히 정보 제공용입니다.
-v, --자세한
진행 표시기가 인쇄되도록 합니다.
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 fa2dna 사용
