이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 실행할 수 있는 명령 fuzznuce입니다.
프로그램:
이름
fuzznuc - 뉴클레오티드 시퀀스의 패턴 검색
개요
퍼즈넉 -순서 시퀄 -무늬 무늬 -보어 부울 -아웃파일 신고
퍼즈넉 -도움
기술
퍼즈넉 EMBOSS("유럽 분자 생물학 오픈"의 명령줄 프로그램입니다.
소프트웨어 제품군”). "Nucleic:Motifs" 명령 그룹의 일부입니다.
옵션
입력 섹션에 있어야 합니다.
-순서 시퀄
-무늬 무늬
뉴클레오타이드에 대한 표준 IUPAC 한 글자 코드가 사용됩니다. 기호 'n'은
뉴클레오티드가 허용되는 위치에 사용됩니다. 모호성은 다음으로 표시됩니다.
대괄호 '[
]'. 예: [ACG]는 A 또는 C 또는 G를 나타냅니다. 모호성은 다음으로도 표시됩니다.
한 쌍의 중괄호 '{ }' 사이에 허용되지 않는 뉴클레오티드 나열
주어진 위치에서. 예: {AG}는 A와 G를 제외한 모든 뉴클레오티드를 나타냅니다.
패턴의 요소는 '-'로 인접 요소와 구분됩니다. (fuzznuc에서 선택 사항).
패턴 요소의 반복은 해당 요소를 따라 표시될 수 있습니다.
숫자 값 또는 괄호 사이의 숫자 범위. 예: N(3)
NNN에 해당하고 N(2,4)는 NN 또는 NNN 또는 NNNN에 해당합니다. 패턴일 때
시퀀스의 5' 또는 3' 끝으로 제한되며 해당 패턴은 다음 중 하나로 시작합니다.
'<' 기호 또는 각각 '>' 기호로 끝납니다. 마침표는 패턴을 종료합니다.
(fuzznuc에서 선택 사항). 예: [CG](5)TG{A}N(1,5)C
Advnaced 섹션에 있어야 합니다.
-보어 부울
기본값: N
산출 섹션에 있어야 합니다.
-아웃파일 신고
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 fuzznuce 사용
