이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 공급자에서 실행할 수 있는 명령 gap5입니다.
프로그램:
이름
gap5 - 게놈 조립 프로그램(staden 패키지의 일부)
개요
갭5 [-로] [-maxseq ] [-maxdb ] [-skip_notes] [DATABASE_NAME.V]
기술
Gap5는 게놈 조립 프로그램입니다. 이 프로그램에는 모든 도구가 포함되어 있습니다.
조립 프로그램에서 기대할 수 있는 많은 고유 기능과 매우 쉽게 사용할 수 있는
상호 작용. 원래 버전은 Bonfield, JK, Smith, KF 및 Staden, R에 설명되어 있습니다. ㅏ
새로운 DNA 서열 조립 프로그램. 핵산 Res. 24, 4992-4999 (1995)
Gap5는 매우 크고 강력합니다. 모두가 옵션의 하위 집합을 사용하고
액세스하고 사용하는 가장 좋아하는 방법. 많긴 하지만 유저들은
문서 전체를 한 번 살펴보고 무엇이 있는지 알아보도록 권장합니다.
가능하고 자신의 작업에 가장 적합한 방식입니다. 최소한 이 전체
입문 장을 읽어야 장기적으로 볼 때 시간이 절약됩니다.
옵션
-로 읽기 전용
-maxseq N
초기 최대 총 합의 길이
-maxdb N
contigs + 판독값의 초기 최대 수
-(no_)체크
(금지) DB 오픈 시 Check Database 실행
-(no_)exec_notes
(금지) 데이터베이스 오픈 시 OPEN/CLOS 노트 실행
-(no_)rawdata_note
(하지 마십시오) RAWDATA 환경 대신 RAWD 메모를 사용하십시오. 변하기 쉬운
-(아니요_)csel
(하지 마십시오) db가 열릴 때 contig 선택기를 시작하십시오.
-디스플레이
X 디스플레이 사용
-비트 크기 N
새 데이터베이스에 대한 보조 파일 비트 크기를 지정합니다(32/64).
-동조 디스플레이 서버에 동기 모드 사용(디버깅)
-- 인수 목록의 끝
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 gap5 사용
