Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 실행할 수 있는 glam2-purge 명령입니다.
프로그램:
이름
glam2-purge - FASTA 파일에서 중복 시퀀스를 제거합니다.
개요
글램2 퍼지 파일 점수 [옵션]
기술
글램2 퍼지 Andrew Neuwald의 수정된 버전입니다. 하제 중복을 제거하는 프로그램
FASTA 파일의 시퀀스. 이는 매우 유사한 것을 방지하기 위해 권장됩니다.
모티프 검색을 왜곡하는 시퀀스. 퍼지는 DNA 또는 단백질과 함께 작동합니다.
시퀀스를 생성하고 두 시퀀스에 (간극 없는) 로컬이 없도록 출력 파일을 생성합니다.
사용자가 지정한 임계값보다 큰 정렬 점수입니다. 출력 파일의 이름은 다음과 같습니다.
. . 정렬 점수는 단백질의 BLOSUM62 매트릭스와
DNA에 대한 +5/-1 점수 체계. 퍼지는 직렬 반복을 마스크하는 데에도 사용할 수 있습니다. 그것은
이를 위한 XNU 프로그램입니다.
옵션
-n
서열은 DNA입니다(기본값: 단백질).
-b
폭발적 휴리스틱 방법을 사용합니다(단백질의 경우 기본값).
-e
철저한 방법을 사용합니다(DNA의 경우 기본값).
-q
세트의 첫 번째 시퀀스를 유지합니다.
-x
xnu를 사용하여 단백질 직렬 반복을 마스크합니다.
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 glam2-purge를 사용하세요.
