hmm2fetch - 클라우드에서의 온라인

프로그램:

이름

hmm2fetch - HMM 데이터베이스에서 HMM 검색

개요

흠2페치 [옵션] 데이터베이스 name

기술

흠2페치 이라는 HMM을 검색하는 작은 유틸리티입니다. name HMMER 모델 데이터베이스에서
라는 데이터 베이스. 새로운 형식으로 변환하고 해당 모델을 표준 출력으로 인쇄합니다. 예를 들어,
흠2페치 팜 rrm Pfam에서 RRM(RNA 인식 모티프) 모델을 검색합니다.
환경 변수 HMMERDB는 Pfam 데이터베이스의 위치로 설정됩니다. 검색된
HMM 파일은 HMMER 2 ASCII 형식으로 작성됩니다.

데이터베이스에는 연결된 GSI 인덱스 파일이 있어야 합니다. HMM 데이터베이스를 색인화하려면 다음을 사용하십시오.
프로그램 hmm2index.

옵션

-h 간단한 도움말 인쇄 다음을 포함한 모든 옵션의 버전 번호 및 요약이 포함됩니다.
전문가 옵션.

-n 해석하다 name 이름 대신 HMM 번호로. 번호는 0부터 시작됩니다.
예를 들어 HMM 데이터베이스에서 첫 번째 HMM을 가져오려면 푸, 당신은 할 것입니다
흠2페치 -n 0 푸.

onworks.net 서비스를 사용하여 온라인으로 hmm2fetch를 사용하세요.