이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 실행할 수 있는 hmmpress 명령입니다.
프로그램:
이름
hmmpress - hmmscan을 위한 HMM 데이터베이스 준비
개요
흠 [옵션]
기술
프로필 데이터베이스에서 시작 표준 HMMER3 형식으로 바이너리를 구성합니다.
압축된 데이터 파일 흠 스캔. 그만큼 흠 단계가 필요합니다 흠 스캔 작동합니다.
XNUMX개의 파일이 생성됩니다. .h3m, .h3i, .h3f및 .h3p.
XNUMXD덴탈의 .h3m 파일에는 프로필 HMM과 해당 주석이 바이너리 형식으로 포함되어 있습니다.
XNUMXD덴탈의 .h3i 파일은 SSI 인덱스입니다. .h3m 파일. 그만큼 .h3f 파일
빠른 휴리스틱 필터(MSV 필터)에 대해 미리 계산된 데이터 구조를 포함합니다. 그만큼
.h3p 파일에는 각 프로필의 나머지 부분에 대해 미리 계산된 데이터 구조가 포함되어 있습니다.
'-'(대시)가 아닐 수 있습니다. 달리기 흠 표준 입력 스트림이 아닌
파일이 허용되지 않습니다.
옵션
-h 돕다; 명령줄 사용 및 사용 가능한 모든 옵션에 대한 간략한 알림을 인쇄합니다.
-f 힘; 이전 hmmpress'ed 데이터 파일을 덮어씁니다. 기본값은 나쁜 짓을 하는 것입니다.
기존 파일이 있으면 먼저 삭제하도록 요청합니다.
onworks.net 서비스를 이용하여 온라인으로 hmmpress를 이용해보세요
