Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 공급자에서 실행할 수 있는 ilink 명령입니다.
프로그램:
이름
ilink - 세타 벡터의 로컬 최적값을 찾기 위한 GEMINI 최적화 절차
재조합 분획의
개요
iLink를 [옵션] ipedfile.dat pedfile.dat
기술
이 매뉴얼 페이지는 간략하게 설명합니다 iLink를 명령. 사실 이것은 아주 원초적인 의도다.
Debian GNU/Linux 배포판에는 각 프로그램이 다음을 수행해야 하므로 맨페이지를 제공합니다.
맨페이지가 있습니다. 모든 개선 사항은 크게 감사하겠습니다.
iLink를 는 패스트링크 소프트웨어 패키지.
ILINK는 GEMINI 최적화 절차를 사용하여 세타의 로컬 최적 값을 찾습니다.
재조합 분획의 벡터. lcp에서 생성한 기본 스크립트를 사용하는 경우
세타에 대한 초기 추측은 모든 차원에서 .1입니다. GEMINI는 각 세타를
혈통 우도가 더 높은 세타 벡터를 찾으려고 합니다.
GEMINI 절차에는 여러 번의 반복이 있습니다. 각 반복은 한 줄에 해당합니다.
산출. 각 반복에는 다중 우도 함수 평가가 포함됩니다. 각 반복
두 단계가 있습니다. XNUMX단계에서 GEMINI는 현재 최상의 세타를 개선하려고 합니다. XNUMX단계에서는
GEMINI는 현재 최상의 세타에 대한 우도의 기울기를 추정합니다.
벡터. 첫 번째 반복에서 XNUMX단계는 초기의 우도만 평가합니다.
후보 세타.
ILINK가 다음과 같은 라인을 인쇄하면 maxcensor can reduce to -32767, 완료되었습니다.
첫 번째 우도 함수 평가. 장기적으로 이 사실을 추정하는 데 사용할 수 있습니다.
시간을 실행. 함수 평가 횟수에 대한 합리적인 대략적인 추정치는 다음과 같습니다.
10*(세타 벡터의 차원 수). 세타 벡터의 차원 수는
대부분의 경우 유전자좌 수보다 하나 적습니다. maletheta와 femaletheta가 허용되는 경우
다르면(sexdif가 1로 설정됨) 차원의 수가 2 *로 두 배가 됩니다.
위치 - 1). 다른 매개변수를 추정하면(fitmodel이 true로 설정된 상태에서)
차원 수.
에 대한 자세한 내용을 보려면 iLink를 파일을 읽는 것이 유용할 수 있습니다.
/usr/share/doc/fastlink/README.ILINK 데비안 GNU/리눅스 시스템이 있다면.
옵션
옵션이 있을 수 있지만 그에 대한 정보를 찾지 못했습니다. 앞으로 해주세요
그들에 대한 모든 정보를[이메일 보호]>
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