Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 공급자에서 실행할 수 있는 macs2_bdgopt 명령입니다.
프로그램:
이름
macs2_bdgopt - 칩 시퀀싱을 위한 모델 기반 분석
기술
사용법: macs2 bdgopt [-h] -i IFILE [-m {곱하기, 더하기, p2q}]
[-p [추가 PARAM [추가 PARAM ...]]] [--outdir OUTDIR] -o
파일
선택 인수 :
-h, --도움
이 도움말 메시지를 표시하고 종료
-i 아이파일, --ifile 아이파일
bedGraph의 MACS 점수입니다. 참고: 이것은 전체를 포함하는 bedGraph 파일이어야 합니다.
게놈. 필수의
-m {곱하기, 더하기, p2q}, --방법 {곱하기, 더하기, p2q}
bedGraph 파일의 점수 열을 수정하는 방법. 사용 가능한 선택 사항은 다음과 같습니다.
곱하기, 더하기 또는 p2q. 1) 곱하기, EXTRAPARAM이 필요하며
점수 열에 곱해집니다. 점수 열을 X로 나누려면 다음을 사용하십시오.
EXTRAPARAM으로 1/X의 값. 2) 추가, EXTRAPARAM이 필요하며 다음에 추가됩니다.
점수 열. 점수 열을 X로 빼려는 경우 다음 값을 사용하십시오. -X
EXTRAPARAM으로. 3) p2q, 다음을 사용하여 p-값 점수를 q-값 점수로 변환합니다.
Benjamini-Hochberg 프로세스. EXTRAPARAM은 필요하지 않습니다. 이 방법은 다음을 가정합니다.
점수는 -로그10 MACS2의 p-값. 다른 유형의 점수는
예상치 못한 오류.
-p [추가 매개변수 [추가 매개변수 ...]], --추가 매개변수 [추가 매개변수 [추가 매개변수 ...]]
METHOD에 대한 추가 매개변수입니다. 의 세부사항을 확인하십시오 -m 옵션을 선택합니다.
--outdir 아웃디어
지정하면 모든 출력 파일이 해당 디렉토리에 기록됩니다. 기본값:
현재 작업 디렉토리
-o 파일, --offile 파일
출력 BEDGraph 파일 이름.
onworks.net 서비스를 사용하여 온라인에서 macs2_bdgopt 사용
