이것은 Ubuntu Online, Fedora Online, Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MAC OS 온라인 에뮬레이터와 같은 여러 무료 온라인 워크스테이션 중 하나를 사용하여 OnWorks 무료 호스팅 제공업체에서 실행할 수 있는 uc-echo 명령입니다.
프로그램:
이름
uc-echo - 짧은 읽기 오류 수정
개요
uc-에코 [옵션] read_file_name
옵션
-h, --도움
이 도움말 메시지를 표시하고 종료
-o OUTPUT_FILENAME, --산출=OUTPUT_FILENAME
출력 파일 이름
-l 로그_파일이름, --통나무=LOG_FILENAME
로그 파일 이름
--DD=TMP_DIRECTORY, --tmp_dir=TMP_DIRECTORY
임시 데이터 디렉토리
-u NCPU, --ncpu=NCPU
훈련에 사용되는 프로세스 수
-b B사이즈, --블록_크기=B사이즈
데이터를 지정된 크기의 블록으로 분할
--nh=내쉬, --n_hash_block=내쉬
해시 테이블을 n개의 테이블로 분할
--NS=읽기_병합, --read_merge_size=읽기_병합
n개의 해시 테이블을 한 번에 병합
--흠=해시_병합, --hash_merge_batch_size=해시_병합
n개의 인접 목록을 한 번에 병합
-k K, --kmer=K
해싱에 사용되는 k-mer 크기
-e E, --min_error_tolerance=E
매개변수 검색에 대한 최소 오류 허용 오차
-E E, --max_error_tolerance=E
매개변수 검색에 대한 최대 오류 허용 오차
--아아=H, --최소_최소_겹침=H
매개변수 검색을 위한 최소 최소 중첩 길이
--hH=H, --max_minimum_overlap=H
매개변수 검색을 위한 최대 최소 중첩 길이
--h_속도=H_RATE, --이형접합성 비율=H_RATE
이형접합 사이트 요금
--model_selection_size=크기
모델 선택 데이터 세트 크기
--keep_all_files
모든 임시 파일을 보관하십시오. 기본적으로 임시 파일은 자동으로 삭제됩니다.
-h, --도움
이 도움말 메시지를 표시하고 종료
-o OUTPUT_FILENAME, --산출=OUTPUT_FILENAME
출력 파일 이름
-l 로그_파일이름, --통나무=LOG_FILENAME
로그 파일 이름
--DD=TMP_DIRECTORY, --tmp_dir=TMP_DIRECTORY
임시 데이터 디렉토리
-u NCPU, --ncpu=NCPU
훈련에 사용되는 프로세스 수
-b B사이즈, --블록_크기=B사이즈
데이터를 지정된 크기의 블록으로 분할
--nh=내쉬, --n_hash_block=내쉬
해시 테이블을 n개의 테이블로 분할
--NS=읽기_병합, --read_merge_size=읽기_병합
n개의 해시 테이블을 한 번에 병합
--흠=해시_병합, --hash_merge_batch_size=해시_병합
n개의 인접 목록을 한 번에 병합
-k K, --kmer=K
해싱에 사용되는 k-mer 크기
-e E, --min_error_tolerance=E
매개변수 검색에 대한 최소 오류 허용 오차
-E E, --max_error_tolerance=E
매개변수 검색에 대한 최대 오류 허용 오차
--아아=H, --최소_최소_겹침=H
매개변수 검색을 위한 최소 최소 중첩 길이
--hH=H, --max_minimum_overlap=H
매개변수 검색을 위한 최대 최소 중첩 길이
--h_속도=H_RATE, --이형접합성 비율=H_RATE
이형접합 사이트 요금
--model_selection_size=크기
모델 선택 데이터 세트 크기
--keep_all_files
모든 임시 파일을 보관하십시오. 기본적으로 임시 파일은 자동으로 삭제됩니다.
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