This is the Linux app named clusterProfiler whose latest release can be downloaded as clusterProfilersourcecode.tar.gz. It can be run online in the free hosting provider OnWorks for workstations.
clusterProfiler라는 앱을 OnWorks와 함께 무료로 다운로드하여 온라인에서 실행해보세요.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
스크린 샷
Ad
클러스터프로파일러
기술
clusterProfiler는 고처리량 오믹스 결과를 해석하기 위한 기능적 농축 분석을 위한 통합 워크플로를 제공하는 R/Bioconductor 패키지입니다. 과대표성 분석과 유전자 집합 농축 분석을 모두 지원하여, 차등 파이프라인에서 순위가 매겨지지 않은 유전자 목록이나 순위가 매겨진 통계를 다룰 수 있습니다. 이 패키지는 일관된 인터페이스를 통해 Gene Ontology, KEGG, Reactome, Disease Ontology, MeSH 등 다양한 지식 베이스와 연결되므로 코드를 다시 작성하지 않고도 다양한 생물학적 관점을 쿼리할 수 있습니다. 지속적으로 업데이트되는 주석을 활용하여 코딩 및 비코딩 특징과 수천 개의 유기체를 포괄하는 광범위한 기능을 제공하도록 설계되었습니다. 결과는 깔끔하고 조작하기 쉬운 구조로 반환되며, 경로, 용어 및 유전자 집합 관계를 요약하는 풍부한 시각화 기능(컴패니언 툴링 사용)과 자연스럽게 연동됩니다.
기능
- 여러 주석 소스에 걸친 통합 ORA 및 GSEA 워크플로
- 최신 유전자 주석을 사용한 광범위한 종 지원
- 다운스트림 R 데이터 파이프라인과 깔끔하게 통합되는 깔끔한 출력
- 동반 플로팅 도구를 통한 농축 결과의 내장된 시각화
- 교차 조건 분석을 위한 다중 그룹 비교 유틸리티(예: compareCluster)
- 재현 가능한 종단 간 농축 연구를 위한 자세한 비네트 및 매뉴얼
프로그래밍 언어
R
카테고리
이 애플리케이션은 https://sourceforge.net/projects/clusterprofiler.mirror/에서도 다운로드할 수 있습니다. OnWorks에 호스팅되어 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉽게 온라인에서 실행할 수 있도록 설계되었습니다.
