이것은 최신 릴리스를 CNVision.tar.gz로 다운로드할 수 있는 Linux 온라인에서 실행되는 CNVision이라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
CNVision이라는 이 앱을 온라인으로 다운로드하고 실행하여 OnWorks와 함께 Linux에서 무료로 실행하십시오.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
스크린 샷
Ad
CNVision, 온라인에서 Linux에서 실행
기술
CNVision은 PennCNV, QuantiSNPv300 및 GNOSIS(내장 알고리즘)를 통해 Illumina 유전자형 데이터(2.3k에서 최신 Omni까지 모든 칩)를 실행하는 Perl 스크립트입니다. 결과를 병합하고 원시 데이터의 품질을 평가합니다. CNVision은 또한 원시 유전자형 데이터를 기반으로 한 부모에서 CNV의 가능성을 고려하는 매우 정확한 알고리즘을 사용하여 가족 기반 데이터에서 새로운 CNV를 식별할 수 있습니다.스크립트는 UNIX 기반 환경에서 작동하도록 최적화되어 있습니다. Windows에서 작동해야 하지만 PennCNV 구성 요소를 실행하면 최신 버전의 PennCNV에서 오류가 발생합니다.
CNVision은 SSC(Simons Simplex Collection) 자폐증 데이터에 대한 데이터를 분석하기 위해 작성되었습니다. 방법에 대한 설명은 CNVision을 참조하는 데 사용할 수 있는 다음 문서에 나와 있습니다.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21658581
오디언스 (Audience)
과학/연구
사용자 인터페이스
콘솔/터미널
프로그래밍 언어
펄
https://sourceforge.net/projects/cnvision/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
