이것은 최신 릴리스를 JDACO_1.03.zip으로 다운로드할 수 있는 Linux 온라인에서 실행되는 DACO-algorithm이라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
DACO 알고리즘이라는 이 앱을 다운로드하여 온라인으로 실행하면 OnWorks와 함께 Linux 온라인에서 무료로 실행할 수 있습니다.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
스크린 샷
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Linux 온라인에서 실행되는 DACO 알고리즘
기술
진핵 생물의 유전자 발현은 다양한 요인의 조절 신호를 결합하는 분자 논리 회로를 통해 제어됩니다. 전사 인자 및 기타 조절 단백질의 복합화는 중요한 조절 경로 내에서 신호 통합의 우세하고 고도로 보존된 메커니즘이며 제어된 유전자 및 행사된 조절 메커니즘을 추론할 수 있습니다.우리는 단백질-단백질 상호 작용 네트워크와 도메인-도메인 상호 작용 네트워크를 클러스터 품질 메트릭 응집성과 결합하는 새로운 알고리즘인 DACO(도메인 인식 응집성 최적화)를 개발했습니다. 메트릭은 단백질 상호 작용의 전체적인 수준에서 로컬로 최대화되는 반면 도메인 수준의 정교한 연결 제약 조건은 이러한 어셈블리 내 상호 작용의 배타적이고 본질적으로 조합적인 특성을 설명하는 데 활용됩니다.
원본 간행물은 다음에서 찾을 수 있습니다. http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/30/17/i415 .
오디언스 (Audience)
과학/연구
사용자 인터페이스
콘솔/터미널
프로그래밍 언어
파이썬, 자바
이것은 https://sourceforge.net/projects/dacoalgorithm/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.