최신 릴리스를 FASTQsim_v2.0.tgz로 다운로드할 수 있는 Linux 온라인에서 실행하는 FASTQSim이라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
FASTQSim이라는 이 앱을 다운로드하여 온라인으로 실행하면 OnWorks와 함께 Linux 온라인에서 무료로 실행할 수 있습니다.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
Linux 온라인에서 실행되는 FASTQSim
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기술
FASTQSim은 Next-Gen Sequencing 데이터 세트 특성화 및 metagenomic 데이터 생성의 이중 기능을 제공하는 도구입니다.FASTQSim은 시퀀싱 플랫폼에 독립적이며 모든 시퀀싱에 대한 판독 길이, 품질 점수, 인델 비율, 단일 점 돌연변이 비율, 인델 크기 및 유사한 통계의 분포를 계산합니다.
플랫폼. 교육 또는 테스트 데이터 세트를 생성하기 위해 FASTQSim은 대상 시퀀스를 일치하는 in silico 읽기로 변환하는 기능이 있습니다.
오류 프로필.
FASTQsim을 사용하면 시퀀싱 프로젝트를 계획하거나 metagenomic 소프트웨어를 벤치마킹하기 위한 표준화된 테스트 시나리오로 사용할 수 있는 개별 읽기 데이터 세트를 시뮬레이션할 수 있습니다. 이와 관련하여 FASTQsim 도구로 생성된 in silico 데이터 세트는 자연 데이터 세트에 비해 몇 가지 장점을 가지고 있습니다. 즉, 플랫폼 독립적인 시퀀싱이고 특성이 매우 우수하며 생성 비용이 저렴합니다.
이것은 https://sourceforge.net/projects/fastqsim/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
