이것은 최신 릴리스를 genoo-code-2013_04_18.tar.gz로 다운로드할 수 있는 Linux 온라인에서 실행되는 GenOO-HTS라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
GenOO-HTS라는 이 앱을 온라인으로 다운로드하여 실행하면 OnWorks와 함께 Linux 온라인에서 무료로 실행할 수 있습니다.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
스크린 샷
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Linux 온라인에서 실행되는 GenOO-HTS
기술
GenOO-HTS [jee-noo]는 오픈 소스입니다. HTS(고처리량 시퀀싱) 분석 도구 설계를 위해 특별히 개발된 객체 지향 Perl 프레임워크입니다. GenOO-HTS의 주요 목표는 간단한 HTS 분석을 쉽고 복잡한 분석을 가능하게 하는 것입니다. GenOO-HTS는 생물학적 개체를 Perl 개체로 모델링하고 높은 처리량 시퀀싱 데이터의 조작을 허용하는 관련 속성 및 방법을 제공합니다. GenOO-HTS를 핵심 개발 모듈로 사용하면 데이터와 생물학적 개체를 관리하는 오버헤드와 복잡성이 줄어듭니다. GenOO-HTS는 모듈식 구조와 외부 도구 및 라이브러리에 대한 최소 요구 사항으로 유연하고 쉽게 확장할 수 있도록 설계되었습니다.기능
- 생물학적 개체를 perl 개체로 구성합니다(게놈 영역, 유전자, 전사체, 인트론/엑손 등).
- 시퀀싱 엔티티를 perl 객체/속성으로 구성(시퀀싱 읽기, 정렬 등)
- 널리 사용되는 파일 형식(SAM, BED, FASTA, FASTQ)에서 I/O를 쉽게 만듭니다.
- 일관성 있고 쉽게 확장 가능
오디언스 (Audience)
과학/연구, 개발자
프로그래밍 언어
펄
https://sourceforge.net/projects/genoo/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
