GMATAv2.2.jar로 최신 릴리스를 다운로드할 수 있는 Genomic SSR 마커용 GMATA 소프트웨어라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks와 함께 Genomic SSR 마커용 GMATA 소프트웨어라는 이 앱을 무료로 다운로드하여 온라인으로 실행하십시오.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
스크린 샷
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게놈 SSR 마커용 GMATA 소프트웨어
기술
소프트웨어 GMATA v21이란 무엇입니까?
GMATA(Genome-wide Microsatellite Analyzing Toward Application)는 SSR(Simple Sequence Repeats) 분석 및 모든 DNA 서열에서 SSR 마커 설계 및 매핑을 위한 소프트웨어입니다. 다음과 같은 기능이 있습니다.
1. SSR 채굴
2. 통계 분석 및 도표 작성
3. SSR 좌위 그래픽 보기;
4. 마커 디자인;
5. 전자 매핑 및 마커 이전 가능성 조사.
GMATA는 정확하고 민감하며 빠릅니다. 대규모 게놈 서열 데이터 세트, 특히 대규모 전체 게놈 서열을 처리하도록 설계되었습니다. 이론적으로 GMATA는 모든 크기의 게놈을 쉽게 분석할 수 있습니다. 소프트웨어 GMATA는 서버, 데스크탑 또는 랩탑에서도 작동하며 클릭만으로 그래픽 인터페이스에서 실행하거나 명령줄 또는 자동화된 파이프라인에서 실행할 수 있습니다. 또한 크로스 플랫폼이며 Unix/Linux, Win 및 Mac을 지원합니다. 소프트웨어 GMATA의 결과는 Gbrowser의 게놈 또는 유전자 기능과 함께 그래픽으로 직접 표시될 수 있으며 모든 게놈 데이터베이스와 쉽게 통합됩니다.
특징
- 모든 대규모 시퀀스에서 정확하고 빠른 SSR 마이닝
- 완전한 통계 분석 및 플로팅
- 게놈 기능이 있는 Gbrowser에 표시되는 SSR 유전자좌 및 마커 그래픽
- 특정 SSR 마커 설계 및 시뮬레이션 PCR
- 전자 매핑 및 마커 이전 가능성 조사
- 에서도 사용 가능 https://github.com/XuewenWangUGA/GMATA.git
https://sourceforge.net/projects/gmata/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.