LocusVu.tar.gz로 최신 릴리스를 다운로드할 수 있는 Linux 온라인에서 실행되는 locusvu라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
Locusvu라는 이 앱을 온라인으로 다운로드하여 실행하면 OnWorks와 함께 Linux 온라인에서 무료로 실행할 수 있습니다.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
스크린 샷
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Linux 온라인에서 실행되는 locusvu
기술
LocusVu는 게놈 유전자좌(염색체의 위치) 목록을 입력으로 받아들이고 UCSC 게놈 브라우저와 같은 공용 데이터베이스에서 관련 정보(세포 유전 밴드, 유전자 이름, OMIM 데이터 등)를 자동으로 가져오는 새로운 Java 기반 소프트웨어 도구입니다. 데이터 베이스. 그런 다음 여러 데이터 세트(비교 유전체학) 비교, 도구 자체 내에서 유전자좌에 대한 인접 유전자 보기 또는 막대/파이 차트에서 이러한 결과를 그래픽으로 나타내는 것과 같이 검색된 결과에 대한 여러 워크플로를 활성화합니다. LocusVu는 기본 로직과 직관적인 사용자 상호 작용을 가능하게 하는 사용하기 쉬운 간단한 GUI를 프런트엔드에 제공합니다.이 도구는 다른 데이터베이스(예: Ensembl)에 대한 지원을 추가하거나 정보를 가져오도록 쉽게 확장할 수 있습니다.
데이터베이스의 다른 테이블에서. 따라서 LocusVu는 사용자와 개발자 모두 기존 워크플로우를 단순화하고 유전체학에서 데이터 분석을 지원하는 새로운 워크플로우를 만드는 데 사용할 수 있는 기본 프레임워크를 제공합니다.
기능
- 데이터베이스(현재 UCSC 게놈 브라우저 데이터베이스)에서 데이터 검색을 자동화합니다.
- 다음과 같이 검색된 결과에 대한 워크플로우를 활성화합니다.
- ..여러 데이터 세트 비교(비교 유전체학)
- ..위치에 대한 인접 유전자 보기(도구 자체 내에서)
- ..결과를 그래픽으로 표시(막대/파이 차트)
- 직관적인 사용을 위한 프런트엔드의 사용하기 쉬운 GUI
- 쉬운 디버깅을 위해 Log4j로 로깅
- 쉽게 확장 가능
오디언스 (Audience)
과학/연구, 개발자
사용자 인터페이스
자바 스윙
프로그래밍 언어
자바
데이터베이스 환경
MySQL의
이것은 https://sourceforge.net/projects/locusvu/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
