LocusVu.tar.gz๋ก ์ต์ ๋ฆด๋ฆฌ์ค๋ฅผ ๋ค์ด๋ก๋ํ ์ ์๋ Linux ์จ๋ผ์ธ์์ ์คํ๋๋ locusvu๋ผ๋ Linux ์ฑ์ ๋๋ค. ์ํฌ์คํ ์ด์ ์ฉ ๋ฌด๋ฃ ํธ์คํ ์ ๊ณต์ ์ฒด์ธ OnWorks์์ ์จ๋ผ์ธ์ผ๋ก ์คํํ ์ ์์ต๋๋ค.
Locusvu๋ผ๋ ์ด ์ฑ์ ์จ๋ผ์ธ์ผ๋ก ๋ค์ด๋ก๋ํ์ฌ ์คํํ๋ฉด OnWorks์ ํจ๊ป Linux ์จ๋ผ์ธ์์ ๋ฌด๋ฃ๋ก ์คํํ ์ ์์ต๋๋ค.
์ด ์ฑ์ ์คํํ๋ ค๋ฉด ๋ค์ ์ง์นจ์ ๋ฐ๋ฅด์ธ์.
- 1. ์ด ์ ํ๋ฆฌ์ผ์ด์ ์ PC์ ๋ค์ด๋ก๋ํ์ต๋๋ค.
- 2. ํ์ผ ๊ด๋ฆฌ์ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX์ ์ํ๋ ์ฌ์ฉ์ ์ด๋ฆ์ ์ ๋ ฅํฉ๋๋ค.
- 3. ์ด๋ฌํ ํ์ผ ๊ด๋ฆฌ์์์ ์ด ์์ฉ ํ๋ก๊ทธ๋จ์ ์ ๋ก๋ํฉ๋๋ค.
- 4. ์ด ์น์ฌ์ดํธ์์ OnWorks Linux ์จ๋ผ์ธ ๋๋ Windows ์จ๋ผ์ธ ์๋ฎฌ๋ ์ดํฐ ๋๋ MACOS ์จ๋ผ์ธ ์๋ฎฌ๋ ์ดํฐ๋ฅผ ์์ํฉ๋๋ค.
- 5. ๋ฐฉ๊ธ ์์ํ OnWorks Linux OS์์ ์ํ๋ ์ฌ์ฉ์ ์ด๋ฆ์ผ๋ก ํ์ผ ๊ด๋ฆฌ์ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX๋ก ์ด๋ํฉ๋๋ค.
- 6. ์์ฉ ํ๋ก๊ทธ๋จ์ ๋ค์ด๋ก๋ํ์ฌ ์ค์นํ๊ณ ์คํํฉ๋๋ค.
์คํฌ๋ฆฐ ์ท
Ad
Linux ์จ๋ผ์ธ์์ ์คํ๋๋ locusvu
๊ธฐ์
LocusVu๋ ๊ฒ๋ ์ ์ ์์ข(์ผ์์ฒด์ ์์น) ๋ชฉ๋ก์ ์ ๋ ฅ์ผ๋ก ๋ฐ์๋ค์ด๊ณ UCSC ๊ฒ๋ ๋ธ๋ผ์ฐ์ ์ ๊ฐ์ ๊ณต์ฉ ๋ฐ์ดํฐ๋ฒ ์ด์ค์์ ๊ด๋ จ ์ ๋ณด(์ธํฌ ์ ์ ๋ฐด๋, ์ ์ ์ ์ด๋ฆ, OMIM ๋ฐ์ดํฐ ๋ฑ)๋ฅผ ์๋์ผ๋ก ๊ฐ์ ธ์ค๋ ์๋ก์ด Java ๊ธฐ๋ฐ ์ํํธ์จ์ด ๋๊ตฌ์ ๋๋ค. ๋ฐ์ดํฐ ๋ฒ ์ด์ค. ๊ทธ๋ฐ ๋ค์ ์ฌ๋ฌ ๋ฐ์ดํฐ ์ธํธ(๋น๊ต ์ ์ ์ฒดํ) ๋น๊ต, ๋๊ตฌ ์์ฒด ๋ด์์ ์ ์ ์์ข์ ๋ํ ์ธ์ ์ ์ ์ ๋ณด๊ธฐ ๋๋ ๋ง๋/ํ์ด ์ฐจํธ์์ ์ด๋ฌํ ๊ฒฐ๊ณผ๋ฅผ ๊ทธ๋ํฝ์ผ๋ก ๋ํ๋ด๋ ๊ฒ๊ณผ ๊ฐ์ด ๊ฒ์๋ ๊ฒฐ๊ณผ์ ๋ํ ์ฌ๋ฌ ์ํฌํ๋ก๋ฅผ ํ์ฑํํฉ๋๋ค. LocusVu๋ ๊ธฐ๋ณธ ๋ก์ง๊ณผ ์ง๊ด์ ์ธ ์ฌ์ฉ์ ์ํธ ์์ฉ์ ๊ฐ๋ฅํ๊ฒ ํ๋ ์ฌ์ฉํ๊ธฐ ์ฌ์ด ๊ฐ๋จํ GUI๋ฅผ ํ๋ฐํธ์๋์ ์ ๊ณตํฉ๋๋ค.์ด ๋๊ตฌ๋ ๋ค๋ฅธ ๋ฐ์ดํฐ๋ฒ ์ด์ค(์: Ensembl)์ ๋ํ ์ง์์ ์ถ๊ฐํ๊ฑฐ๋ ์ ๋ณด๋ฅผ ๊ฐ์ ธ์ค๋๋ก ์ฝ๊ฒ ํ์ฅํ ์ ์์ต๋๋ค.
๋ฐ์ดํฐ๋ฒ ์ด์ค์ ๋ค๋ฅธ ํ ์ด๋ธ์์. ๋ฐ๋ผ์ LocusVu๋ ์ฌ์ฉ์์ ๊ฐ๋ฐ์ ๋ชจ๋ ๊ธฐ์กด ์ํฌํ๋ก์ฐ๋ฅผ ๋จ์ํํ๊ณ ์ ์ ์ฒดํ์์ ๋ฐ์ดํฐ ๋ถ์์ ์ง์ํ๋ ์๋ก์ด ์ํฌํ๋ก์ฐ๋ฅผ ๋ง๋๋ ๋ฐ ์ฌ์ฉํ ์ ์๋ ๊ธฐ๋ณธ ํ๋ ์์ํฌ๋ฅผ ์ ๊ณตํฉ๋๋ค.
ํน์ง
- ๋ฐ์ดํฐ๋ฒ ์ด์ค(ํ์ฌ UCSC ๊ฒ๋ ๋ธ๋ผ์ฐ์ ๋ฐ์ดํฐ๋ฒ ์ด์ค)์์ ๋ฐ์ดํฐ ๊ฒ์์ ์๋ํํฉ๋๋ค.
- ๋ค์๊ณผ ๊ฐ์ด ๊ฒ์๋ ๊ฒฐ๊ณผ์ ๋ํ ์ํฌํ๋ก์ฐ๋ฅผ ํ์ฑํํฉ๋๋ค.
- ..์ฌ๋ฌ ๋ฐ์ดํฐ ์ธํธ ๋น๊ต(๋น๊ต ์ ์ ์ฒดํ)
- ..์์น์ ๋ํ ์ธ์ ์ ์ ์ ๋ณด๊ธฐ(๋๊ตฌ ์์ฒด ๋ด์์)
- ..๊ฒฐ๊ณผ๋ฅผ ๊ทธ๋ํฝ์ผ๋ก ํ์(๋ง๋/ํ์ด ์ฐจํธ)
- ์ง๊ด์ ์ธ ์ฌ์ฉ์ ์ํ ํ๋ฐํธ์๋์ ์ฌ์ฉํ๊ธฐ ์ฌ์ด GUI
- ์ฌ์ด ๋๋ฒ๊น ์ ์ํด Log4j๋ก ๋ก๊น
- ์ฝ๊ฒ ํ์ฅ ๊ฐ๋ฅ
์ค๋์ธ์ค (Audience)
๊ณผํ/์ฐ๊ตฌ, ๊ฐ๋ฐ์
์ฌ์ฉ์ ์ธํฐํ์ด์ค
์๋ฐ ์ค์
ํ๋ก๊ทธ๋๋ฐ ์ธ์ด
์๋ฐ
๋ฐ์ดํฐ๋ฒ ์ด์ค ํ๊ฒฝ
MySQL์
์ด๊ฒ์ https://sourceforge.net/projects/locusvu/์์๋ ๊ฐ์ ธ์ฌ ์ ์๋ ์ ํ๋ฆฌ์ผ์ด์ ์ ๋๋ค. ๋ฌด๋ฃ ์ด์ ์ฒด์ ์ค ํ๋์์ ๊ฐ์ฅ ์ฌ์ด ๋ฐฉ๋ฒ์ผ๋ก ์จ๋ผ์ธ์ผ๋ก ์คํํ๊ธฐ ์ํด OnWorks์์ ํธ์คํ ๋์์ต๋๋ค.