์ด๊ฒ์ MANTIS_3.3.tar.gz๋ก ์ต์ ๋ฆด๋ฆฌ์ค๋ฅผ ๋ค์ด๋ก๋ํ ์ ์๋ Linux ์จ๋ผ์ธ์์ ์คํํ๊ธฐ ์ํ MANTIS R ํจํค์ง๋ผ๋ Linux ์ฑ์ ๋๋ค. ์ํฌ์คํ ์ด์ ์ฉ ๋ฌด๋ฃ ํธ์คํ ์ ๊ณต์ ์ฒด์ธ OnWorks์์ ์จ๋ผ์ธ์ผ๋ก ์คํํ ์ ์์ต๋๋ค.
MANTIS R Package๋ผ๋ ์ด ์ฑ์ ๋ค์ด๋ก๋ํ์ฌ ์จ๋ผ์ธ์ผ๋ก ์คํํ๋ฉด OnWorks๋ฅผ ํตํด Linux ์จ๋ผ์ธ์์ ๋ฌด๋ฃ๋ก ์คํํ ์ ์์ต๋๋ค.
์ด ์ฑ์ ์คํํ๋ ค๋ฉด ๋ค์ ์ง์นจ์ ๋ฐ๋ฅด์ธ์.
- 1. ์ด ์ ํ๋ฆฌ์ผ์ด์ ์ PC์ ๋ค์ด๋ก๋ํ์ต๋๋ค.
- 2. ํ์ผ ๊ด๋ฆฌ์ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX์ ์ํ๋ ์ฌ์ฉ์ ์ด๋ฆ์ ์ ๋ ฅํฉ๋๋ค.
- 3. ์ด๋ฌํ ํ์ผ ๊ด๋ฆฌ์์์ ์ด ์์ฉ ํ๋ก๊ทธ๋จ์ ์ ๋ก๋ํฉ๋๋ค.
- 4. ์ด ์น์ฌ์ดํธ์์ OnWorks Linux ์จ๋ผ์ธ ๋๋ Windows ์จ๋ผ์ธ ์๋ฎฌ๋ ์ดํฐ ๋๋ MACOS ์จ๋ผ์ธ ์๋ฎฌ๋ ์ดํฐ๋ฅผ ์์ํฉ๋๋ค.
- 5. ๋ฐฉ๊ธ ์์ํ OnWorks Linux OS์์ ์ํ๋ ์ฌ์ฉ์ ์ด๋ฆ์ผ๋ก ํ์ผ ๊ด๋ฆฌ์ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX๋ก ์ด๋ํฉ๋๋ค.
- 6. ์์ฉ ํ๋ก๊ทธ๋จ์ ๋ค์ด๋ก๋ํ์ฌ ์ค์นํ๊ณ ์คํํฉ๋๋ค.
Linux ์จ๋ผ์ธ์์ ์คํ๋๋ MANTIS R ํจํค์ง
Ad
๊ธฐ์
์ด ๋ฆฌํฌ์งํ ๋ฆฌ์๋ Multi-locus ANTIgenic Simulator R-ํจํค์ง์ธ MANTIS์ ์ต์ ์ฝ๋ ๋ฒ์ ์ด ํฌํจ๋์ด ์์ต๋๋ค.MANTIS๋ ์๊ตญ ์ฅ์คํผ๋ ๋ํ๊ต ๋๋ฌผํ๊ณผ์ EEID(Evolutionary Ecology of Infectious Disease) ์ฐ๊ตฌ ๊ทธ๋ฃน์์ ๊ฐ๋ฐ ๋ฐ ์ ์ง ๊ด๋ฆฌํฉ๋๋ค.
์ด๋ก ์ ๋ฐฐ๊ฒฝ์ 'MANTIS: ๋ณ์์ฒด ์งํ์ ๋ค์ค ์์น ๋ชจ๋ธ์ ์๋ฎฌ๋ ์ด์ ํ๋ R ํจํค์ง'(https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12859-015-0598-9 ์คํ ์ก์ธ์ค)
ํ์ฌ MANTIS๋ CRAN์์ ์ฌ์ฉํ ์ ์์ต๋๋ค.
MANTIS์ ์์ค ํจํค์ง๋ฅผ ๋น๋ํ๋ ค๋ฉด buildPackage.R ์คํฌ๋ฆฝํธ๋ฅผ ์ฌ์ฉํ์ญ์์ค.
MANTIS๋ฅผ ์ค์นํ๋ ค๋ฉด 'install.packages(file.tar.gz,type="src",repo=NULL)'์ ์ฌ์ฉํ์ญ์์ค.
ํ ์คํธํ๋ ค๋ฉด test_V3.3_code.R์ ์ฌ์ฉํ์ญ์์ค.
์์ธํ ๋ด์ฉ์ ์ ๊ฐํ๋ฌผ์ ์ฃผ ์ ์์๊ฒ ๋ฌธ์ํ์ญ์์ค.
๋์๋ผ!
์ค๋์ธ์ค (Audience)
๊ณผํ/์ฐ๊ตฌ, ๊ต์ก
ํ๋ก๊ทธ๋๋ฐ ์ธ์ด
S / R
์ด๊ฒ์ https://sourceforge.net/projects/mantis-r-package/์์๋ ๊ฐ์ ธ์ฌ ์ ์๋ ์ ํ๋ฆฌ์ผ์ด์ ์ ๋๋ค. ๋ฌด๋ฃ ์ด์ ์ฒด์ ์ค ํ๋์์ ๊ฐ์ฅ ์ฌ์ด ๋ฐฉ๋ฒ์ผ๋ก ์จ๋ผ์ธ์ผ๋ก ์คํํ๊ธฐ ์ํด OnWorks์์ ํธ์คํ ๋์์ต๋๋ค.