이는 Linux 온라인에서 실행되는 miRDP2라는 Linux 앱으로, 최신 릴리스는 miRDP2-v1.1.4.tar.gz로 다운로드할 수 있습니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
miRDP2라는 이 앱을 온라인으로 다운로드하여 실행하면 OnWorks를 통해 온라인으로 Linux에서 무료로 실행할 수 있습니다.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
Linux 온라인에서 실행되는 miRDP2
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기술
miRDeep-P2(miRDP2)는 식물의 microRNA(miRNA) 전사체를 정확하고 빠르게 분석하기 위해 개발되었습니다. 새로운 전략과 정밀한 알고리즘으로 miRDeep-P(miRDP)에서 채택되었습니다. 우리는 애기장대, 쌀, 토마토, 옥수수 및 밀과 같이 게놈 크기가 점차 증가하는 식물에서 miRNA 전사체를 분석하기 위해 miRDP2를 테스트했습니다. miRDeep-P 및 기타 여러 계산 도구와 비교할 때 miRDP2는 NGS 데이터를 우수한 속도로 처리했습니다. 새로 업데이트된 식물 miRNA 주석 기준을 통합하여 miRDP2의 정확도도 크게 향상되었습니다. 우리의 결과는 miRDP2가 식물에서 miRNA 전사체를 분석하기 위한 빠르고 정확한 도구임을 보여줍니다.참조 : https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty972
기능
- 작은 RNA
- 마이크로RNA(miRNA)
- 차세대 시퀀싱 (NGS)
- 펄
오디언스 (Audience)
과학/연구
프로그래밍 언어
펄
데이터베이스 환경
펄 DBI/DBD
https://sourceforge.net/projects/mirdp2/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 우리의 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
