이것은 최신 릴리스를 Pontos-3.0.jar로 다운로드할 수 있는 Linux 온라인에서 실행되는 Pontos라는 Linux 앱입니다. 워크스테이션용 무료 호스팅 제공업체인 OnWorks에서 온라인으로 실행할 수 있습니다.
OnWorks와 함께 Linux 온라인에서 무료로 실행하려면 Pontos라는 이 앱을 온라인으로 다운로드하여 실행하십시오.
이 앱을 실행하려면 다음 지침을 따르세요.
- 1. 이 애플리케이션을 PC에 다운로드했습니다.
- 2. 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX에 원하는 사용자 이름을 입력합니다.
- 3. 이러한 파일 관리자에서 이 응용 프로그램을 업로드합니다.
- 4. 이 웹사이트에서 OnWorks Linux 온라인 또는 Windows 온라인 에뮬레이터 또는 MACOS 온라인 에뮬레이터를 시작합니다.
- 5. 방금 시작한 OnWorks Linux OS에서 원하는 사용자 이름으로 파일 관리자 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX로 이동합니다.
- 6. 응용 프로그램을 다운로드하여 설치하고 실행합니다.
스크린 샷
Ad
Linux 온라인에서 실행되는 Pontos
기술
Pontos는 PHYLIP 형식의 DNA 서열 정렬에서 보정되지 않은 거리(또는 유사성) 행렬을 계산하기 위한 사용하기 쉬운 그래픽 Java 프로그램입니다. 또한 일반 정렬과 "차이" 정렬을 생성합니다(반대의 경우도 마찬가지).다양한 방식으로 격차와 모호성을 처리할 수 있습니다.
간격은 다음과 같을 수 있습니다.
- 모두 사용;
- 모두 무시됨;
- 쌍을 이루는 방식으로 시퀀스의 끝에서만 무시됩니다.
- 끝에서만 무시되지만 이제는 전체적으로 무시됩니다(효과적으로 끝에서 가장 먼 시퀀스에 대한 전체 정렬 트리밍).
모호성(DNA 서열의 R, Y, N, W 등)은 다음과 같이 처리할 수 있습니다.
- 모호함을 항상 다른 것으로 간주합니다.
- 모호성을 부분적으로 다른 것으로 간주합니다(예: R은 A 또는 G와 0.5 다를 것임).
- 각 쌍별 비교에서 모호성을 무시합니다.
- 모호함을 나타내는 모든 열을 전역적으로 제거합니다.
Pontos는 Linux로 작성되었지만 Java가 작동하는 모든 시스템에서 실행되어야 합니다. Pontos는 GPL 버전 3에 따라 라이센스가 부여됩니다.
오디언스 (Audience)
과학/연구, 최종 사용자/데스크톱
사용자 인터페이스
자바 스윙
프로그래밍 언어
자바
이것은 https://sourceforge.net/projects/pontos/에서도 가져올 수 있는 애플리케이션입니다. 무료 운영 체제 중 하나에서 가장 쉬운 방법으로 온라인으로 실행하기 위해 OnWorks에서 호스팅되었습니다.
