์ด๊ฒ์ SecStAnT.jar๋ก ์ต์ ๋ฆด๋ฆฌ์ค๋ฅผ ๋ค์ด๋ก๋ํ ์ ์๋ Linux ์จ๋ผ์ธ์์ ์คํ๋๋ SecStAnT๋ผ๋ Linux ์ฑ์ ๋๋ค. ์ํฌ์คํ ์ด์ ์ฉ ๋ฌด๋ฃ ํธ์คํ ์ ๊ณต์ ์ฒด์ธ OnWorks์์ ์จ๋ผ์ธ์ผ๋ก ์คํํ ์ ์์ต๋๋ค.
SecStAnT๋ผ๋ ์ด ์ฑ์ ๋ค์ด๋ก๋ํ์ฌ ์จ๋ผ์ธ์ผ๋ก ์คํํ๋ฉด OnWorks๋ฅผ ํตํด Linux ์จ๋ผ์ธ์์ ๋ฌด๋ฃ๋ก ์คํํ ์ ์์ต๋๋ค.
์ด ์ฑ์ ์คํํ๋ ค๋ฉด ๋ค์ ์ง์นจ์ ๋ฐ๋ฅด์ธ์.
- 1. ์ด ์ ํ๋ฆฌ์ผ์ด์ ์ PC์ ๋ค์ด๋ก๋ํ์ต๋๋ค.
- 2. ํ์ผ ๊ด๋ฆฌ์ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX์ ์ํ๋ ์ฌ์ฉ์ ์ด๋ฆ์ ์ ๋ ฅํฉ๋๋ค.
- 3. ์ด๋ฌํ ํ์ผ ๊ด๋ฆฌ์์์ ์ด ์์ฉ ํ๋ก๊ทธ๋จ์ ์ ๋ก๋ํฉ๋๋ค.
- 4. ์ด ์น์ฌ์ดํธ์์ OnWorks Linux ์จ๋ผ์ธ ๋๋ Windows ์จ๋ผ์ธ ์๋ฎฌ๋ ์ดํฐ ๋๋ MACOS ์จ๋ผ์ธ ์๋ฎฌ๋ ์ดํฐ๋ฅผ ์์ํฉ๋๋ค.
- 5. ๋ฐฉ๊ธ ์์ํ OnWorks Linux OS์์ ์ํ๋ ์ฌ์ฉ์ ์ด๋ฆ์ผ๋ก ํ์ผ ๊ด๋ฆฌ์ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX๋ก ์ด๋ํฉ๋๋ค.
- 6. ์์ฉ ํ๋ก๊ทธ๋จ์ ๋ค์ด๋ก๋ํ์ฌ ์ค์นํ๊ณ ์คํํฉ๋๋ค.
์คํฌ๋ฆฐ ์ท
Ad
Linux ์จ๋ผ์ธ์์ ์คํ๋๋ SecStAnT
๊ธฐ์
SecStAnT๋ ์ฌ์ฉ์ ์ ์ ๊ตฌ์กฐ ๊ตฌ์ฑ์ ์ฌ์ฉํ์ฌ PDB(Protein Data Bank)์์ ๊ตฌ์กฐ์ ๋ฐ์ดํฐ ์ธํธ๋ฅผ ์๋์ผ๋ก ์์ฑํ๊ณ ๋ด๋ถ ๋ณ์ ๋ถํฌ๋ฅผ ๊ณ์ฐํ๊ธฐ ์ํ ๋๊ตฌ์ ๋๋ค.SecStAnT๋ ๋ค์์ ์ํํ ์ ์์ต๋๋ค.
1. ์ฌ์ฉ์ ์ง์ XNUMX์ฐจ ๊ตฌ์กฐ(๋ด๋ถ PDB ๋ถ๋ฅ ๋๋ DSSP๋ฅผ ๊ธฐ๋ฐ์ผ๋ก ์ ์๋จ) ๋ฐ/๋๋ ์ํ์ค ๋๊ธฐ๋ฅผ ๊ธฐ๋ฐ์ผ๋ก ๊ตฌ์กฐ์ PDB ๋ฐ์ดํฐ ์ธํธ์์ ์ ํํฉ๋๋ค.
2. ๋ค์ํ ์์ค์ ๋ถํด๋ฅ์ผ๋ก ๋ฐ์ดํฐ ์ธํธ ๊ตฌ์ถ(๋ชจ๋ ์์, ๋ฐฑ๋ณธ๋ง, Cฮฑ๋ง, ...)
3. ๋ด๋ถ ๋ณ์์ ํต๊ณ ๋ถํฌ๋ฅผ ํ๊ฐํฉ๋๋ค.
ใ . ๋จ์ผ ๋ณ์ ๋ถํฌ(์: PHI ๋ฐ PSI ๋ฐ Cฮฑ ๊ธฐ๋ฐ ํํ์ ๋ํ ๋ค์์ ์์์ ํํ๊ณผ ๊ฐ์ฅ ๊ด๋ จ ์๋ ๋ถํฌ ํฌํจ)
๋น. ๋ ๊ฐ์ ๋ณ์ ์๊ด๊ด๊ณ(PHI-PSI Ramachandran ๋งต ๋ฐ Cฮฑ ๊ธฐ๋ฐ ํํ์ ๋ฑ๊ฐ๋ฌผ ํฌํจ)
์จ. ์ธ ๋ณ์ ์๊ด ๊ด๊ณ
์ฌ์ฉ์ ์ธํฐํ์ด์ค
์๋ฐ ์ค์
ํ๋ก๊ทธ๋๋ฐ ์ธ์ด
์๋ฐ
์ด๊ฒ์ https://sourceforge.net/projects/secstant/์์๋ ๊ฐ์ ธ์ฌ ์ ์๋ ์ ํ๋ฆฌ์ผ์ด์ ์ ๋๋ค. ๋ฌด๋ฃ ์ด์ ์ฒด์ ์ค ํ๋์์ ๊ฐ์ฅ ์ฌ์ด ๋ฐฉ๋ฒ์ผ๋ก ์จ๋ผ์ธ์ผ๋ก ์คํํ๊ธฐ ์ํด OnWorks์์ ํธ์คํ ๋์์ต๋๋ค.