์ด๊ฒ์ WindowsRelease.zip์ผ๋ก ์ต์ ๋ฆด๋ฆฌ์ค๋ฅผ ๋ค์ด๋ก๋ํ ์ ์๋ Molecular Dynamics Studio๋ผ๋ Windows ์ฑ์ ๋๋ค. ์ํฌ์คํ ์ด์ ์ฉ ๋ฌด๋ฃ ํธ์คํ ์ ๊ณต์ ์ฒด์ธ OnWorks์์ ์จ๋ผ์ธ์ผ๋ก ์คํํ ์ ์์ต๋๋ค.
OnWorks์ ํจ๊ป Molecular Dynamics Studio๋ผ๋ ์ด ์ฑ์ ๋ฌด๋ฃ๋ก ๋ค์ด๋ก๋ํ์ฌ ์จ๋ผ์ธ์์ ์คํํ์ญ์์ค.
์ด ์ฑ์ ์คํํ๋ ค๋ฉด ๋ค์ ์ง์นจ์ ๋ฐ๋ฅด์ธ์.
- 1. ์ด ์ ํ๋ฆฌ์ผ์ด์ ์ PC์ ๋ค์ด๋ก๋ํ์ต๋๋ค.
- 2. ํ์ผ ๊ด๋ฆฌ์ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX์ ์ํ๋ ์ฌ์ฉ์ ์ด๋ฆ์ ์ ๋ ฅํฉ๋๋ค.
- 3. ์ด๋ฌํ ํ์ผ ๊ด๋ฆฌ์์์ ์ด ์์ฉ ํ๋ก๊ทธ๋จ์ ์ ๋ก๋ํฉ๋๋ค.
- 4. ์ด ์น์ฌ์ดํธ์์ ๋ชจ๋ OS OnWorks ์จ๋ผ์ธ ์๋ฎฌ๋ ์ดํฐ๋ฅผ ์์ํ์ง๋ง ๋ ๋์ Windows ์จ๋ผ์ธ ์๋ฎฌ๋ ์ดํฐ๋ฅผ ์์ํฉ๋๋ค.
- 5. ๋ฐฉ๊ธ ์์ํ OnWorks Windows OS์์ ์ํ๋ ์ฌ์ฉ์ ์ด๋ฆ์ผ๋ก ํ์ผ ๊ด๋ฆฌ์ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX๋ก ์ด๋ํฉ๋๋ค.
- 6. ์ ํ๋ฆฌ์ผ์ด์ ์ ๋ค์ด๋ก๋ํ์ฌ ์ค์นํฉ๋๋ค.
- 7. Linux ๋ฐฐํฌ ์ํํธ์จ์ด ์ ์ฅ์์์ Wine์ ๋ค์ด๋ก๋ํฉ๋๋ค. ์ค์น๊ฐ ์๋ฃ๋๋ฉด ์ฑ์ ๋ ๋ฒ ํด๋ฆญํ์ฌ Wine๊ณผ ํจ๊ป ์คํํ ์ ์์ต๋๋ค. ์ธ๊ธฐ ์๋ Windows ํ๋ก๊ทธ๋จ ๋ฐ ๊ฒ์์ ์ค์นํ๋ ๋ฐ ๋์์ด ๋๋ Wine์ ํตํ ๋ฉ์ง ์ธํฐํ์ด์ค์ธ PlayOnLinux๋ฅผ ์ฌ์ฉํด ๋ณผ ์๋ ์์ต๋๋ค.
Wine์ Linux์์ Windows ์ํํธ์จ์ด๋ฅผ ์คํํ๋ ๋ฐฉ๋ฒ์ด์ง๋ง Windows๊ฐ ํ์ํ์ง ์์ต๋๋ค. Wine์ ๋ชจ๋ Linux ๋ฐ์คํฌํ์์ ์ง์ Windows ํ๋ก๊ทธ๋จ์ ์คํํ ์ ์๋ ์คํ ์์ค Windows ํธํ์ฑ ๊ณ์ธต์ ๋๋ค. ๋ณธ์ง์ ์ผ๋ก Wine์ Windows๊ฐ ํ์ํ์ง ์๊ณ ๋ชจ๋ Windows ์์ฉ ํ๋ก๊ทธ๋จ์ ์คํํ ์ ์๋๋ก Windows๋ฅผ ์ฒ์๋ถํฐ ์ถฉ๋ถํ ๋ค์ ๊ตฌํํ๋ ค๊ณ ํฉ๋๋ค.
์คํฌ๋ฆฐ ์ท
Ad
๋ถ์๋์ญํ ์คํ๋์ค
๊ธฐ์
์ด๊ฒ์ ๋ถ์ ์ญํ ์ธํฌ๋ฅผ ์ฝ๊ฒ ์์ฑํ ๋ชฉ์ ์ผ๋ก NanoEngineer-1, PACKMOL ๋ฐ MSI2LMP๋ฅผ ํตํฉํ๊ธฐ ์ํด ์์ฑ๋ ์ํํธ์จ์ด ์์ ๋ชจ์์ ๋๋ค. NanoEngineer-1์ Nanorex๊ฐ ์์ฑํ ๋ถ์ CAD ์ํํธ์จ์ด๋ก ์ฌ์ฉ์์๊ฒ ๋ถ์๋ฅผ ์์ฑํ๋ ์ฌ์ด ๋ฐฉ๋ฒ์ ์ ๊ณตํ๋ฉฐ ์ํํธ์จ์ด ์์ ์ ํตํด ์ฌ์ฉ์๋ ์ฌ๋ฌ ํ์ฅ์ ์ฌ์ฉํ์ฌ ์์๋ฅผ ์ ๋ ฅํ ์ ์์ต๋๋ค. PACKMOL์ NanoEngineer-1์ ๋ถ์ ํ ํ๋ฆฟ์ ์ฌ์ฉํ์ฌ ๋ถ์์ ๋ฌด์์ ์ปฌ๋ ์ ์ ์์ฑํ์ฌ ์ด๊ธฐ MD ์ ์ ์ ๊ณตํ ์ ์์ต๋๋ค. PACKMOL์ ์์ ํ๋ฉด ์์ ์ ํ ๋ฐ์ดํฐ๋ฅผ MSI2LMP ์ํํธ์จ์ด๋ก ์ ๋ฌํ ์ ์์ต๋๋ค. MSI2LMP๋ ํด๋์ค I ๋๋ ํด๋์ค II ํฌ์ค ํ๋๋ฅผ ๊ธฐ๋ฐ์ผ๋ก LAMMPS ์ ๋ ฅ ํ์ผ์ ์์ฑํฉ๋๋ค. MSI2LMP๋ NanoEngineer-1์ ์ํด ์์ฑ๋ ์์น์ ์ผ๋ก ์ฝ๋ฉ๋ ํฌ์ค ํ๋ ๋ฐ์ดํฐ๋ฅผ ์ฌ์ฉํ๋๋ก ์์ ๋์์ต๋๋ค. MMP ํ์ผ ํ์์ด ํ์ฅ๋์ด ์ธ ๊ฐ์ง ์ํํธ์จ์ด ์์ฉ ํ๋ก๊ทธ๋จ ๋ชจ๋์ ํตํฉ๋์์ต๋๋ค.http://www.nanoengineer-1.net
http://www.ime.unicamp.br/~martinez/packmol/
http://lammps.sandia.gov/
ํน์ง
- NanoEngineer-1์ ํตํ ๋ถ์ CAD ๊ธฐ๋ฅ
- CFF91 ์์๋ ฅ์ฅ์ ๊ธฐ๋ฐ์ผ๋ก ์์๋ฅผ ์๋์ผ๋ก ์ ๋ ฅ
- NanoEngineer-1์ ์ฌ์ฉํ์ฌ ๋ถ์ ํ ํ๋ฆฟ ์์ฑ
- PACKMOL ๋ฐ ๋ค์ค ๋ถ์ ํ ํ๋ฆฟ์ ์ฌ์ฉํ์ฌ MD ์ธํฌ ์์ฑ
- MSI2LMP๋ฅผ ์ฌ์ฉํ์ฌ LAMMPS ์ง์ค๋ฉํธ๋ฆฌ ์ ๋ ฅ ํ์ผ ์์ฑ
์ค๋์ธ์ค (Audience)
๊ณผํ/์ฐ๊ตฌ
์ฌ์ฉ์ ์ธํฐํ์ด์ค
์คํGL, Qt
ํ๋ก๊ทธ๋๋ฐ ์ธ์ด
ํฌํธ๋, ํ์ด์ฌ, C++, C
์ด๊ฒ์ https://sourceforge.net/projects/moleculardynami/์์๋ ๊ฐ์ ธ์ฌ ์ ์๋ ์ ํ๋ฆฌ์ผ์ด์ ์ ๋๋ค. ์ฐ๋ฆฌ์ ๋ฌด๋ฃ ์ด์ ์ฒด์ ์ค ํ๋์์ ๊ฐ์ฅ ์ฌ์ด ๋ฐฉ๋ฒ์ผ๋ก ์จ๋ผ์ธ์ผ๋ก ์คํํ๊ธฐ ์ํด OnWorks์์ ํธ์คํ ๋์์ต๋๋ค.