ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ bowtie2-inspect ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
bowtie2-inspect - wrapper ສໍາລັບ bowtie2-inspect-* index
ສະຫຼຸບສັງລວມ
bowtie2-ກວດກາ [ທາງເລືອກໃນການ]*
ລາຍລະອຽດ
Bowtie 2 ຮຸ່ນ 2.2.6 ໂດຍ Ben Langmead ([email protected], www.cs.jhu.edu/~langmea)
ຊື່ໄຟລ໌ bt2 ລົບຕໍ່ທ້າຍ .1.bt2/.2.bt2
ໂດຍຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ, ພິມບັນທຶກ FASTA ຂອງລໍາດັບ nucleotide ທີ່ຖືກດັດສະນີເປັນມາດຕະຖານ
ອອກ. ກັບ -n, ພຽງແຕ່ພິມຊື່. ກັບ -s, ພຽງແຕ່ພິມບົດສະຫຼຸບຂອງດັດສະນີ
ຕົວກໍານົດການແລະລໍາດັບ. ກັບ -e, ຮັກສາສີຖ້າມີ.
OPTIONS
--ດັດຊະນີໃຫຍ່
ບັງຄັບໃຫ້ກວດກາດັດຊະນີ 'ໃຫຍ່', ເຖິງແມ່ນວ່າມີ 'ນ້ອຍ'.
-a// ຂ້າມ
ຈໍານວນຕົວອັກສອນໃນການຜະລິດ FASTA (ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 60)
-n// ຊື່
ພິມຊື່ລໍາດັບການອ້າງອີງເທົ່ານັ້ນ
-s// ສະຫຼຸບ
ພິມບົດສະຫຼຸບລວມ. ຊື່ອ້າງອີງ, ຄວາມຍາວ, ຄຸນສົມບັດດັດສະນີ
-e//-bt2-ref
ສ້າງການອ້າງອີງຈາກ .bt2 (ຊ້າ, ຮັກສາສີ)
-v// ຄຳເວົ້າ
ຜົນຜະລິດ verbose (ສໍາລັບການດີບັກ)
-h// ຊ່ວຍເຫຼືອ
ພິມລາຍລະອຽດຂອງເຄື່ອງມື ແລະທາງເລືອກຂອງມັນ
- ຊ່ວຍ ພິມຂໍ້ຄວາມການນໍາໃຊ້ນີ້
ໃຊ້ bowtie2-inspect ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
