ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ bp_run_protdist.plp ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
run_neighbor - ດໍາເນີນໂຄງການ 'protdist' ຂອງ Phylip ຜ່ານ Bioperl
ສະຫຼຸບສັງລວມ
run_protdist [-i inputfile] [-o outfilename]
ລາຍລະອຽດ
ສະຫນອງໄຟລ໌ການຈັດຕໍາແຫນ່ງເພື່ອດໍາເນີນການ protdist ສຸດ. ໄຟລ໌ຄວນຈະມີຊື່ .aln ຫຼື .phy.
ນີ້ແມ່ນຕ້ອງການເພື່ອໃຫ້ພວກເຮົາສາມາດກໍານົດວ່າພວກເຮົາຕ້ອງການປ່ຽນການຈັດລໍາດັບ clustalw ເປັນ
ຟີລິບ ເຈົ້າຍິນດີທີ່ຈະຂະຫຍາຍສະຄຣິບເພື່ອເຮັດວຽກໃນຮູບແບບ MSA ອື່ນໆທີ່ bioperl
ສະຫນັບສະຫນູນ. ນີ້ມີຈຸດປະສົງເພື່ອນໍາໃຊ້ໃນທໍ່ຄູ່ມືທີ່ງ່າຍດາຍຫຼາຍ.
ໄຟລ໌ປ້ອນຂໍ້ມູນຄວນຈະມີຊື່ໃນຮູບແບບຂອງ file.phy ຫຼື file.aln ທີ່ໂຄງການຄາດວ່າຈະເປັນ
ໄຟລ໌ໃນຮູບແບບຂອງ (\S+)\.(\S+).
ນີ້ຈະດໍາເນີນການຄໍາຮ້ອງສະຫມັກ 'protdist' ໂດຍໃຊ້ສູດ 'KIMURA' ເພື່ອສ້າງທາດໂປຼຕີນຈາກ aa
ມາຕຣິກເບື້ອງໄລຍະຫ່າງ. ຜູ້ທີ່ມີ phylip3.6 ຈະຕ້ອງການເຮັດການປ່ຽນແປງບາງຢ່າງຖ້າພວກເຂົາຕ້ອງການໃຊ້
JTT. ຂ້ອຍຍິນດີທີ່ຈະຊ່ວຍເພີ່ມອັນນີ້ເຂົ້າໃນການໂຕ້ຖຽງ cmd-line ຖ້າມັນຖືກຮ້ອງຂໍ.
ໃຊ້ bp_run_protdist.plp ອອນລາຍໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net