ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ correct_abundances ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
correct_abundances - ດໍາເນີນການຂັ້ນຕອນການແກ້ໄຂຄວາມຄ້າຍຄືກັນຂອງ genome
ສະຫຼຸບສັງລວມ
correct_abundances ຊື່
ລາຍລະອຽດ
ດໍາເນີນການຂັ້ນຕອນການແກ້ໄຂຄວາມຄ້າຍຄືກັນ.
ຫມາຍເຫດ: ເຖິງແມ່ນວ່າມັນເປັນໄປໄດ້ທີ່ຈະດໍາເນີນການອ່ານແຜນທີ່ດ້ວຍມືຫຼືເພື່ອສ້າງຄວາມຄ້າຍຄືກັນ
matrix ດ້ວຍຕົນເອງ, ພວກເຮົາແນະນໍາໃຫ້ໃຊ້ສະຄິບ Python ທີ່ສະຫນອງໃຫ້ 'run_mappers.py'
ແລະ 'create_similarity_matrix.py'.
OPTIONS
ຊື່: ຊື່ໄຟລ໌ຂອງໄຟລ໌ຊື່; ໄຟລ໌ຊື່ຂໍ້ຄວາມທໍາມະດາຄວນມີຫນຶ່ງຊື່ຕໍ່
ສາຍ. ຊື່ຖືກໃຊ້ເປັນຕົວລະບຸໃນ algorithm ທັງໝົດ.
-h, - ຊ່ວຍ
ສະແດງຂໍ້ຄວາມຊ່ວຍເຫຼືອນີ້ ແລະອອກ
-m SMAT, --similarity-matrix=SMAT
ເສັ້ນທາງໄປສູ່ໄຟລ໌ matrix ຄວາມຄ້າຍຄືກັນ. ມາຕຣິກເບື້ອງຄວາມຄ້າຍຄືກັນຈະຕ້ອງຖືກສ້າງດ້ວຍອັນດຽວກັນ
ໄຟລ໌ NAMES. [ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ./similarity_matrix.npy]
-s SAM, --samfiles=SAM
ຮູບແບບທີ່ຊີ້ໄປຫາໄຟລ໌ SAM ທີ່ສ້າງຂຶ້ນໂດຍຜູ້ສ້າງແຜນທີ່. ຕົວຍຶດສໍາລັບຊື່
ແມ່ນ "%s". [ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ./SAM/%s.sam]
-b ບູດ, --bootstrap-ຕົວຢ່າງ=BOOT
ກໍານົດຈໍານວນຂອງຕົວຢ່າງ bootstrap. ໃຊ້ 1 ເພື່ອປິດການໃຊ້ງານ Bootstrapping [ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 100]
-o ອອກ, -- ຜົນຜະລິດ=ອອກໄປ
ໄຟລ໌ອອກຂໍ້ຄວາມທໍາມະດາທີ່ປະກອບດ້ວຍຜົນໄດ້ຮັບ. [ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ./results.txt]
ໃຊ້ correct_abundances ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
