digeste - ອອນລາຍໃນຄລາວ

ໂຄງການ:

NAME

digest - ບົດລາຍງານກ່ຽວກັບ enzyme proteolytic ທາດໂປຼຕີນຫຼືສະຖານທີ່ cleavage reagent

ສະຫຼຸບສັງລວມ

ຍ່ອຍ -seqall seqall -mwdata ຂໍ້ມູນ - ເມ​ນູ​ ບັນຊີລາຍຊື່ - ໂມໂນ ປຸ້ຍ - ບໍ່ພໍໃຈ ປຸ້ຍ
- ຂີ້ຄ້ານ ປຸ້ຍ -termini ບັນຊີລາຍຊື່ - ທັບຊ້ອນກັນ ປຸ້ຍ - allpartials ປຸ້ຍ
-outfile ບົດ​ລາຍ​ງານ

ຍ່ອຍ -ຊ່ວຍ

ລາຍລະອຽດ

ຍ່ອຍ ແມ່ນໂຄງການເສັ້ນຄໍາສັ່ງຈາກ EMBOSS ("The European Molecular Biology Open
Software Suite”). ມັນເປັນສ່ວນຫນຶ່ງຂອງກຸ່ມຄໍາສັ່ງ "Protein: Motifs".

OPTIONS

ການປ້ອນຂໍ້ມູນ ສ່ວນ
-seqall seqall

-mwdata ຂໍ້ມູນ
ຂໍ້ມູນນ້ຳໜັກໂມເລກຸນສຳລັບອາຊິດ amino ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: Emolwt.dat

ທີ່ກໍານົດໄວ້ ສ່ວນ
- ເມ​ນູ​ ບັນຊີລາຍຊື່
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1

- ໂມໂນ ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: N

ແບບ​ພິ​ເສດ ສ່ວນ
- ບໍ່ພໍໃຈ ປຸ້ຍ
ປົກກະຕິແລ້ວ Trypsin ຈະບໍ່ຕັດຫຼັງຈາກ 'KR' ຖ້າພວກມັນຖືກຕິດຕາມດ້ວຍ 'KRIFLP' ໃດໆ.
ປົກກະຕິແລ້ວ Lys-C ຈະບໍ່ຕັດຫຼັງຈາກ 'K' ຖ້າມັນຖືກຕິດຕາມດ້ວຍ 'P'. Arg-C ຈະບໍ່
ປົກກະຕິຕັດຫຼັງຈາກ 'R' ຖ້າມັນຖືກຕິດຕາມດ້ວຍ 'P'. V8-bicarb ຈະບໍ່ຕັດຕາມປົກກະຕິ
'E' ຖ້າມັນຖືກຕິດຕາມດ້ວຍ 'KREP' ອັນໃດນຶ່ງ. V8-phosph ຈະບໍ່ຖືກຕັດຕາມປົກກະຕິຫຼັງຈາກ 'DE' ຖ້າ
ພວກມັນຖືກຕິດຕາມດ້ວຍ 'P'. Chymotrypsin ຈະບໍ່ຕັດຕາມປົກກະຕິຫຼັງຈາກ 'FYWLM' ຖ້າພວກມັນເປັນ
ຕິດຕາມດ້ວຍ 'P'. ການກໍານົດທີ່ບໍ່ເອື້ອອໍານວຍສະແດງໃຫ້ເຫັນການຕັດ unfavoured ເຫຼົ່ານີ້ເຊັ່ນດຽວກັນກັບ
ທີ່ມັກ.

- ຂີ້ຄ້ານ ປຸ້ຍ
ອະນຸຍາດໃຫ້ຍ່ອຍອາຫານເຄິ່ງສະເພາະແລະບໍ່ສະເພາະ. ທາງເລືອກນີ້ແມ່ນເປັນປະໂຫຍດໂດຍສະເພາະ
ສໍາລັບການສ້າງບັນຊີລາຍຊື່ຂອງລໍາດັບ peptide ສໍາລັບການກໍານົດທາດໂປຼຕີນໂດຍໃຊ້
ມວນສານ.

-termini ບັນຊີລາຍຊື່
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1

ຜົນຜະລິດ ສ່ວນ
- ທັບຊ້ອນກັນ ປຸ້ຍ
ໃຊ້ສໍາລັບການຍ່ອຍອາຫານບາງສ່ວນ. ສະແດງການຕັດທັງໝົດຈາກບ່ອນຕັດທີ່ມັກບວກ 1..3, 2..4,
3..5 ແລະ ອື່ນໆ ແຕ່ບໍ່ແມ່ນ (ເຊັ່ນ) 2..5. ດັ່ງນັ້ນການທັບຊ້ອນກັນແມ່ນຊິ້ນສ່ວນທີ່ມີອັນດຽວ
ສະຖານທີ່ຕັດທີ່ມີທ່າແຮງພາຍໃນມັນ.

- allpartials ປຸ້ຍ
ສໍາລັບການທັບຊ້ອນກັນແຕ່ຊິ້ນສ່ວນທີ່ປະກອບມີຫຼາຍກວ່າຫນຶ່ງສະຖານທີ່ຕັດທີ່ເປັນໄປໄດ້.

-outfile ບົດ​ລາຍ​ງານ

ໃຊ້ການຍ່ອຍອາຫານອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net