fastaq-filter - ອອນລາຍໃນຄລາວ

ໂຄງການ:

NAME

fastaq_filter - ລຳດັບການກັ່ນຕອງເພື່ອໃຫ້ໄດ້ຊຸດຍ່ອຍຂອງພວກມັນ

ລາຍລະອຽດ

ການນໍາໃຊ້: fastaq_filter [ຕົວເລືອກ]

ກັ່ນ​ຕອງ​ໄຟລ​໌​ລໍາ​ດັບ​ໂດຍ​ຄວາມ​ຍາວ​ລໍາ​ດັບ​ແລະ / ຫຼື​ໂດຍ​ຊື່​ທີ່​ກົງ​ກັບ​ການ​ສະ​ແດງ​ອອກ​ປົກ​ກະ​ຕິ​

ຕຳ ແໜ່ງ ການໂຕ້ຖຽງ:
infile ຊື່​ຂອງ​ໄຟລ​໌​ປ້ອນ​ຂໍ້​ມູນ​ທີ່​ຈະ​ໄດ້​ຮັບ​ການ​ກັ່ນ​ຕອງ​

outfile
ຊື່ຂອງໄຟລ໌ຜົນຜະລິດ

ທາງເລືອກ ການໂຕ້ຖຽງ:
-h, - ຊ່ວຍ
ສະແດງຂໍ້ຄວາມຊ່ວຍເຫຼືອນີ້ ແລະອອກ

--min_length INT
ຄວາມຍາວຕໍ່າສຸດຂອງລໍາດັບເພື່ອຮັກສາ [0]

--max_length INT
ຄວາມຍາວສູງສຸດຂອງລໍາດັບເພື່ອຮັກສາ [inf]

--regex REGEX
ຖ້າໃຫ້, ພຽງແຕ່ອ່ານທີ່ມີຊື່ທີ່ກົງກັບຄໍາເວົ້າປົກກະຕິຈະຖືກເກັບໄວ້

--ids_file ຊື່​ເອ​ກະ​ສານ
ຖ້າໃຫ້, ພຽງແຕ່ອ່ານ ID ທີ່ມີຢູ່ໃນໄຟລ໌ທີ່ໃຫ້ມາເທົ່ານັ້ນຈະຖືກໃຊ້. ຫນຶ່ງ ID ຕໍ່ແຖວຂອງ
ຍື່ນ.

-v, --ປີ້ນ
ຮັກສາລໍາດັບທີ່ບໍ່ກົງກັບຕົວກອງເທົ່ານັ້ນ

Mate ເອກະສານ ສໍາລັບການ ອ່ານ ຄູ່ ຕົວເລືອກ:
--mate_in ຊື່​ເອ​ກະ​ສານ
ຊື່ຂອງໄຟລ໌ປ້ອນຂໍ້ມູນຄູ່. ຖ້າ​ຫາກ​ວ່າ​ນໍາ​ໃຊ້​, ຍັງ​ຕ້ອງ​ໄດ້​ສະ​ຫນອງ​ໃຫ້​ --mate_out

--mate_out ຊື່​ເອ​ກະ​ສານ
ຊື່ຂອງໄຟລ໌ຜົນຜະລິດຄູ່

-- Both_mates_pass
ໂດຍຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ, ຖ້າຄູ່ທັງສອງຜ່ານການກັ່ນຕອງ, ຫຼັງຈາກນັ້ນທັງສອງຈະອ່ານຜົນຜະລິດ. ໃຊ້ທຸງນີ້ເພື່ອ
ຮຽກຮ້ອງໃຫ້ທັງສອງອ່ານຂອງຄູ່ຜ່ານການກັ່ນຕອງ

ໃຊ້ fastaq-filter ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net