fpromlke - ອອນລາຍໃນຄລາວ

ໂຄງການ:

NAME

fpromlk - ທາດໂປຼຕີນຈາກ phylogeny ໂດຍຄວາມເປັນໄປໄດ້ສູງສຸດ

ສະຫຼຸບສັງລວມ

fpromlk - ລໍາດັບ seqsetall -intreefile ເປັນໄມ້ຢືນຕົ້ນ [- ປະເພດ integer] -ອັດຕາ array
- ປະເພດ ຄຸນສົມບັດ [- ນໍ້າໜັກ ຄຸນສົມບັດ] - ຄວາມ​ຍາວ​ ປຸ້ຍ [- ຮູບແບບ ບັນຊີລາຍຊື່]
[- ແກມມາ ບັນຊີລາຍຊື່] - ປະ​ສິດ​ທິ​ພາບ gamma float -ngammacat integer - invarcoefficient float
-ninvarcat integer - invarfrac float -nhmm ໝວດໝູ່ integer -hmrates array
-hmmprobabilities array -adjsite ປຸ້ຍ - lambda float - ມ່ວນ integer
- ແກ່ນ integer - ທົ່ວໂລກ ປຸ້ຍ [- outgrno integer] -outfile outfile [-trout toggle]
- outtreefile outfile [- ຂໍ້ມູນການພິມ ປຸ້ຍ] [- ຄວາມ​ຄືບ​ຫນ້າ​ ປຸ້ຍ] [- ເປັນ​ໄມ້​ຢືນ​ຕົ້ນ​ ປຸ້ຍ]
[-hypstate ປຸ້ຍ]

fpromlk -ຊ່ວຍ

ລາຍລະອຽດ

fpromlk ແມ່ນໂຄງການເສັ້ນຄໍາສັ່ງຈາກ EMBOSS ("The European Molecular Biology Open
Software Suite”). ມັນເປັນສ່ວນຫນຶ່ງຂອງກຸ່ມຄໍາສັ່ງ "Phylogeny: Molecular sequence" (s).

OPTIONS

ການປ້ອນຂໍ້ມູນ ສ່ວນ
- ລໍາດັບ seqsetall
ໄຟລ໌ທີ່ມີການຈັດຮຽງລໍາດັບໜຶ່ງ ຫຼືຫຼາຍກວ່ານັ້ນ

-intreefile ເປັນໄມ້ຢືນຕົ້ນ

- ປະເພດ integer
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1

-ອັດຕາ array

- ປະເພດ ຄຸນສົມບັດ

- ນໍ້າໜັກ ຄຸນສົມບັດ

ເພີ່ມເຕີມ ສ່ວນ
- ຄວາມ​ຍາວ​ ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: N

- ຮູບແບບ ບັນຊີລາຍຊື່
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: Jones-Taylor-Thornton

- ແກມມາ ບັນຊີລາຍຊື່
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: ນ

- ປະ​ສິດ​ທິ​ພາບ gamma float
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1

-ngammacat integer
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1

- invarcoefficient float
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1

-ninvarcat integer
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1

- invarfrac float
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 0.0

-nhmm ໝວດໝູ່ integer
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1

-hmrates array
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1.0

-hmmprobabilities array
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1.0

-adjsite ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: N

- lambda float
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1.0

- ມ່ວນ integer

- ແກ່ນ integer
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: 1

- ທົ່ວໂລກ ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: N

- outgrno integer

ຜົນຜະລິດ ສ່ວນ
-outfile outfile

-trout toggle
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: Y

- outtreefile outfile

- ຂໍ້ມູນການພິມ ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: N

- ຄວາມ​ຄືບ​ຫນ້າ​ ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: Y

- ເປັນ​ໄມ້​ຢືນ​ຕົ້ນ​ ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: Y

-hypstate ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: N

ໃຊ້ fpromlke ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net