ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ fuzznuce ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
fuzznuc - ຄົ້ນຫາຮູບແບບໃນລໍາດັບ nucleotide
ສະຫຼຸບສັງລວມ
fuzznuc - ລໍາດັບ seqall - ຮູບແບບ ຮູບແບບ - ເສີມ ປຸ້ຍ -outfile ບົດລາຍງານ
fuzznuc -ຊ່ວຍ
ລາຍລະອຽດ
fuzznuc ແມ່ນໂຄງການເສັ້ນຄໍາສັ່ງຈາກ EMBOSS ("The European Molecular Biology Open
Software Suite”). ມັນເປັນສ່ວນຫນຶ່ງຂອງກຸ່ມຄໍາສັ່ງ "Nucleic: Motifs".
OPTIONS
ການປ້ອນຂໍ້ມູນ ສ່ວນ
- ລໍາດັບ seqall
- ຮູບແບບ ຮູບແບບ
ລະຫັດ IUPAC ມາດຕະຖານຕົວອັກສອນດຽວສໍາລັບ nucleotides ແມ່ນຖືກນໍາໃຊ້. ສັນຍາລັກ 'n' ແມ່ນ
ໃຊ້ສໍາລັບຕໍາແຫນ່ງທີ່ nucleotide ໃດຖືກຍອມຮັບ. ຄວາມບໍ່ແນ່ນອນແມ່ນຊີ້ໃຫ້ເຫັນໂດຍ
ລາຍຊື່ຂອງ nucleotides ທີ່ຍອມຮັບໄດ້ສໍາລັບຕໍາແຫນ່ງທີ່ກໍານົດ, ລະຫວ່າງວົງເລັບສີ່ຫຼ່ຽມ '[
]'. ຕົວຢ່າງ: [ACG] ຫຍໍ້ມາຈາກ A ຫຼື C ຫຼື G. ຄວາມບໍ່ແນ່ນອນແມ່ນຍັງສະແດງໂດຍ
ລາຍຊື່ລະຫວ່າງຄູ່ຂອງວົງເລັບ curly '{ }' nucleotides ທີ່ບໍ່ໄດ້ຮັບການຍອມຮັບ
ໃນຕໍາແຫນ່ງທີ່ໄດ້ຮັບ. ຕົວຢ່າງ: {AG} ຫຍໍ້ມາຈາກ nucleotides ໃດໆ ຍົກເວັ້ນ A ແລະ G. ແຕ່ລະອັນ
ອົງປະກອບຢູ່ໃນຮູບແບບແມ່ນແຍກອອກຈາກເພື່ອນບ້ານດ້ວຍ '-'. (ທາງເລືອກໃນ fuzznuc).
ການຊໍ້າຄືນຂອງອົງປະກອບຂອງຮູບແບບສາມາດຊີ້ບອກໄດ້ໂດຍການປະຕິບັດຕາມອົງປະກອບນັ້ນ
ດ້ວຍຄ່າຕົວເລກ ຫຼືໄລຍະຕົວເລກລະຫວ່າງວົງເລັບ. ຕົວຢ່າງ: N(3)
ເທົ່າກັບ NNN, N(2,4) ເທົ່າກັບ NN ຫຼື NNN ຫຼື NNNN. ໃນເວລາທີ່ຮູບແບບແມ່ນ
ຈຳກັດໃຫ້ຢູ່ໃນຈຸດຈົບ 5' ຫຼື 3' ຂອງລຳດັບ, ຮູບແບບນັ້ນຈະເລີ່ມດ້ວຍ a
ສັນຍາລັກ '<' ຫຼືຕາມລໍາດັບລົງທ້າຍດ້ວຍສັນຍາລັກ '>'. ໄລຍະເວລາສິ້ນສຸດຮູບແບບ.
(ທາງເລືອກໃນ fuzznuc). ຕົວຢ່າງ, [CG](5)TG{A}N(1,5)C
ແບບພິເສດ ສ່ວນ
- ເສີມ ປຸ້ຍ
ຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ: N
ຜົນຜະລິດ ສ່ວນ
-outfile ບົດລາຍງານ
ໃຊ້ fuzznuce ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
