ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ gap5 ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍໆບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
gap5 - ໂຄງການ Genome Assembly (ສ່ວນຫນຶ່ງຂອງຊຸດ staden)
ສະຫຼຸບສັງລວມ
ຊ່ອງຫວ່າງ 5 [-ro] [- ສູງສຸດທີ່ເຄຍ ] [-maxdb ] [-skip_notes] [DATABASE_NAME.V]
ລາຍລະອຽດ
Gap5 ແມ່ນໂຄງການ Genome Assembly. ໂຄງການດັ່ງກ່າວປະກອບດ້ວຍເຄື່ອງມືທັງຫມົດທີ່ຈະເປັນ
ຄາດວ່າຈະໄດ້ຈາກໂຄງການການປະກອບບວກກັບລັກສະນະເປັນເອກະລັກຈໍານວນຫຼາຍແລະການນໍາໃຊ້ງ່າຍດາຍຫຼາຍ
ການໂຕ້ຕອບ. ສະບັບຕົ້ນສະບັບໄດ້ຖືກອະທິບາຍໄວ້ໃນ Bonfield, JK, Smith, KF ແລະ Staden, R. ກ
ໂຄງການປະກອບຊຸດ DNA ໃໝ່. ອາຊິດນິວຄລີອິກ Res. 24, 4992-4999 (1995)
Gap5 ແມ່ນໃຫຍ່ຫຼາຍແລະມີອໍານາດ. ທຸກໆຄົນໃຊ້ຊຸດຍ່ອຍຂອງທາງເລືອກແລະມີຂອງພວກເຂົາ
ວິທີການ favorite ຂອງການເຂົ້າເຖິງແລະການນໍາໃຊ້ໃຫ້ເຂົາເຈົ້າ. ເຖິງແມ່ນວ່າມີຫຼາຍຂອງມັນ, ຜູ້ໃຊ້ແມ່ນ
ຊຸກຍູ້ໃຫ້ຜ່ານເອກະສານທັງໝົດຄັ້ງດຽວ, ພຽງແຕ່ຄົ້ນພົບສິ່ງທີ່ເປັນ
ເປັນໄປໄດ້, ແລະວິທີການທີ່ເຫມາະສົມທີ່ສຸດກັບການເຮັດວຽກຂອງຕົນເອງ. ຢ່າງຫນ້ອຍ, ທັງຫມົດນີ້
ບົດແນະນໍາຄວນອ່ານ, ຍ້ອນວ່າໃນໄລຍະຍາວ, ມັນຈະປະຫຍັດເວລາ.
OPTIONS
-ro ອ່ານຢ່າງດຽວ
- ສູງສຸດທີ່ເຄຍ N
ຄວາມຍາວຂອງຄວາມເຫັນດີເຫັນພ້ອມສູງສຸດໃນເບື້ອງຕົ້ນ
-maxdb N
ຈຳນວນສູງສຸດເບື້ອງຕົ້ນຂອງ contigs + ການອ່ານ
-(no_)ກວດ
(ບໍ່) ດໍາເນີນການກວດສອບຖານຂໍ້ມູນເມື່ອ DB ເປີດ
-(no_)exec_notes
(ຢ່າ) ດໍາເນີນການບັນທຶກ OPEN/CLOS ເມື່ອຖານຂໍ້ມູນເປີດ
-(no_)rawdata_note
(ຢ່າ) ໃຊ້ບັນທຶກ RAWD ແທນ RAWDATA env. ຕົວແປ
-(no_)csel
(ຢ່າ) ເລີ່ມຕົ້ນຕົວເລືອກ contig ເມື່ອເປີດ db
- ຈໍສະແດງຜົນ
X ຈໍສະແດງຜົນທີ່ຈະໃຊ້
- ຂະໜາດນ້ອຍ N
ລະບຸຂະໜາດຂອງໄຟລ໌ aux ສໍາລັບຖານຂໍ້ມູນໃໝ່ (32/64)
- ຊິ້ງ ໃຊ້ໂຫມດ synchronous ສໍາລັບເຄື່ອງແມ່ຂ່າຍສະແດງ (debugging)
-- ສິ້ນສຸດລາຍການໂຕ້ແຍ້ງ
ໃຊ້ gap5 ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
