gdcm2vtk - ອອນລາຍໃນຄລາວ

ໂຄງການ:

NAME

gdcm2vtk - ປ່ຽນໄຟລ໌ທີ່ຮອງຮັບໂດຍ VTK ເປັນ DICOM.

ສະຫຼຸບສັງລວມ

gdcm2vtk [ຕົວເລືອກ] file-in file-out

ລາຍລະອຽດ

ໄດ້ gdcm2vtk ໃຊ້ເວລາເປັນໄຟລ໌ທີ່ສະຫນັບສະຫນູນໂດຍ VTK (ລວມທັງໄຟລ໌ DICOM) ແລະຈະ
ສ້າງເປັນຜົນຜະລິດໄຟລ໌ DICOM.

PARAMETERS

file-input ຊື່ໄຟລ໌ (DICOM ຫຼື VTK ຮອງຮັບ)

file-out output ຊື່​ໄຟລ​໌ (DICOM ຫຼື VTK ສະ​ຫນັບ​ສະ​ຫນູນ​)

OPTIONS

ສະເພາະ ທາງເລືອກໃນການ
--force-rescale force rescale.
--force-spacing ໄລຍະຫ່າງຂອງຜົນບັງຄັບໃຊ້.
--palette-color ເມື່ອຮອງຮັບຈະສ້າງໄຟລ໌ PALETTE COLOR.
--argb ເມື່ອຮອງຮັບຈະສ້າງໄຟລ໌ ARGB.
-- ບີບອັດເມື່ອຮອງຮັບສ້າງໄຟລ໌ທີ່ຖືກບີບອັດ.
--use-vtkdicom ໃຊ້ vtkDICOMImageReader (ແທນ GDCM).
--modality ຕັ້ງ Modality.
--lower- left set ຊ້າຍລຸ່ມ.
--shift set shift.
--scale ກໍານົດຂະຫນາດ.
--compress ກໍານົດການບີບອັດ (MetaIO).
-T --study-uid ການສຶກສາ UID.
-S --series-uid Series UID.
--root-uid ຮາກ UID.

compression ທາງເລືອກໃນການ
-J --jpeg ບີບອັດຮູບພາບໃນ jpeg.
-K --j2k ບີບອັດຮູບພາບໃນ j2k.
-L --jpegls ບີບອັດຮູບພາບໃນ jpeg-ls.
-R --rle ບີບອັດຮູບພາບໃນ rle (lossless ເທົ່ານັ້ນ).

ໂດຍທົ່ວໄປ ທາງເລືອກໃນການ
-h --help
ພິມຂໍ້ຄວາມຊ່ວຍເຫຼືອນີ້ ແລະອອກ

-v --ເວີຊັ່ນ
ພິມຂໍ້ມູນສະບັບແລະອອກ

-V --verbose
ຮູບແບບ verbose (ເຕືອນ+ຄວາມຜິດພາດ).

-W --ເຕືອນ
ຮູບ​ແບບ​ການ​ເຕືອນ​ໄພ​, ພິມ​ຂໍ້​ມູນ​ການ​ເຕືອນ​ໄພ​

-E - ຄວາມ​ຜິດ​ພາດ​
ຮູບແບບຄວາມຜິດພາດ, ຂໍ້ມູນຄວາມຜິດພາດການພິມ

-D --debug
ໂໝດດີບັກ, ພິມຂໍ້ມູນດີບັກ

ສະພາບແວດລ້ອມ ຕົວແປ
GDCM_ROOT_UID Root UID

ລາຍລະອຽດ

ປ່ຽນໄຟລ໌ທີ່ຮອງຮັບໂດຍ VTK ເປັນ DICOM.

ການ​ນໍາ​ໃຊ້​ປົກ​ກະ​ຕິ​ແມ່ນ​:

$ gdcm2vtk inputfile output.dcm

ມັນໃຊ້ກົນໄກພາຍໃນໂຮງງານຂອງ VTK ເພື່ອຮັບຮູ້ໄຟລ໌ (ຟັງຊັນ CanRead). ເບິ່ງ
ໄຟລ໌ທີ່ຮອງຮັບ VTK ຢູ່ທີ່ນີ້:

ຮູບແບບໄຟລ໌ຮູບພາບໃດທີ່ VTK ສາມາດອ່ານ ແລະຂຽນໄດ້? http://www.vtk.org/Wiki/VTK_FAQ#What_image_file_formats_can_VTK_read_and_write.3F

ຖ້າໄຟລ໌ປ້ອນຂໍ້ມູນຂອງທ່ານມີ 4 ອົງປະກອບ, comp (alpha) ທີ 4 ຈະຖືກລຶບອອກຈາກຜົນຜະລິດ
ໄຟລ໌ DICOM ບໍ່ຮອງຮັບອົງປະກອບອັນຟາອີກຕໍ່ໄປ (ເບິ່ງ -argb ທາງເລືອກ).

ການ​ດູ​ແລ​ເປັນ​ພິ​ເສດ​ສໍາ​ລັບ​ຮູບ​ແບບ​ໄຟລ​໌​ດັ່ງ​ຕໍ່​ໄປ​ນີ້​:

1. DICOM: Direction Cosines ແລະ vtkMedicalImageInformation ຖືກສົ່ງໄປຫາຜົນໄດ້ຮັບ.
2. BMP: ໄຟລ໌ສາມາດຖືກບັນທຶກໄວ້ດ້ວຍຕາຕະລາງຊອກຫາ (ເບິ່ງ --palette-color)
3. GE Signa: vtkMedicalImageProperties ຖືກສົ່ງກັບຜົນຜະລິດ
4. MINC: Direction Cosines ຖືກສົ່ງໄປຫາຜົນຜະລິດ
5. TIFF: vtkTIFFReader ປະຈຸບັນຢູ່ໃນສະພາບທີ່ບໍ່ດີຢູ່ໃນ VTK (ພຶດຕິກໍາທີ່ແຕກຕ່າງກັນໃນ VTK 5.2 ແລະ git/master). ພຽງແຕ່ໃຊ້ມັນ, ຖ້າທ່ານຮູ້ວ່າທ່ານກໍາລັງເຮັດຫຍັງ.

ແປງ ຮູບພາບ MetaImage (mhd, mha)
$ gdcm2vtk inputfile output.mha

ຄໍາສັ່ງນີ້ຈະປ່ຽນໄຟລ໌ input DICOM: inputfile ເຂົ້າໄປໃນໄຟລ໌ MetaImage .mha. ຄືກັນ
ໄປສໍາລັບໄຟລ໌ .mhd.

ແປງ MHA/MHD
$ gdcm2vtk inputfile output.mha

or

$ gdcm2vtk inputfile output.mhd

ຄຳສັ່ງນີ້ຈະປ່ຽນໄຟລ໌ input DICOM: inputfile ໃຫ້ເປັນ MetaImageData .mha/.mhd
ຍື່ນ.

ແປງ VTI
$ gdcm2vtk inputfile output.vti

ຄຳສັ່ງນີ້ຈະປ່ຽນໄຟລ໌ input DICOM: inputfile ເຂົ້າໄປໃນ XML VTK ImageData .vti.
ຍື່ນ.

ແປງ VTK
$ gdcm2vtk inputfile output.vtk

ຄໍາສັ່ງນີ້ຈະປ່ຽນໄຟລ໌ input DICOM: inputfile ເຂົ້າໄປໃນ VTK Structured ເກົ່າ
ໄຟລ໌ PointSets .vtk.

ແປງ DICOM

$ gdcm2vtk input.dcm output.dcm

vtkGDCMImageReader ຈະຖືກໃຊ້ເພື່ອອ່ານໃນໄຟລ໌ DICOM, ບໍ່ແມ່ນຄ່າເລີ່ມຕົ້ນ
vtkDICOMImageReader. ເບິ່ງທາງເລືອກ –use-vtkdicom ເພື່ອໃຊ້ vtkDICOMImageReader.

ໄປ​ກັບ DICOM ເຖິງ MHD ເຖິງ DICOM

$ gdcm2vtk input_ybr.dcm output.mhd
$ gdcm2vtk --modality US --imageformat 7 output.mhd output.dcm

ການສະທ້ອນຂ້າງເທິງສະແດງໃຫ້ເຫັນວິທີການແປງ DICOM ໂດຍໃຊ້ການຕີຄວາມຫມາຍ Photometric ຂອງ
YBR_FULL (ຫຼືແມ້ກະທັ້ງ YBR_FULL_422 ແມ່ນ lossy) ເຂົ້າໄປໃນຮູບແບບໄຟລ໌ອື່ນ: MetaImage (mhd). ນັບຕັ້ງແຕ່
ຮູບ​ແບບ​ໄຟລ​໌​ນີ້​ບໍ່​ໄດ້​ຈັດ​ການ​ພື້ນ​ທີ່​ສີ​, ພວກ​ເຮົາ​ມີ​ການ​ກໍາ​ນົດ​ຢ່າງ​ຊັດ​ເຈນ​ໂດຍ​ນໍາ​ໃຊ້​
-imageformat ທາງ​ເລືອກ​ເສັ້ນ​ຄໍາ​ສັ່ງ​. ທາງເລືອກແຖວຄໍາສັ່ງ -modality ແມ່ນຕ້ອງການໃນນີ້
ກໍ​ລະ​ນີ​ນັບ​ຕັ້ງ​ແຕ່​ມາດ​ຕະ​ຖານ Secondary Capture Image Storage Class Family ບໍ່​ອະ​ນຸ​ຍາດ​ໃຫ້​ສໍາ​ລັບ YBR​
ການແປພາບຖ່າຍ.

GDCM2VTK ຫມາຍເຫດ

ຫມາຍເຫດສໍາຄັນ: ໂຄງສ້າງ VTK ພາຍໃນຈະຖືກຕື່ມຂໍ້ມູນໃສ່ຈາກວັດສະດຸປ້ອນ DICOM, ແລະຫຼັງຈາກນັ້ນ
ຜ່ານໄປຫາ DICOM writer ຜົນຜະລິດ. ບາງຂໍ້ມູນອາດຈະສູນເສຍໄປໃນລະຫວ່າງການປ່ຽນໃຈເຫລື້ອມໃສ
DICOM ກັບ VTK ຫາ DICOM. ຕົວເລືອກນີ້ສ່ວນຫຼາຍແມ່ນໃຊ້ເພື່ອທົດສອບ
vtkGDCMImageReader/vtkGDCMImageWriter ປະສົມປະສານ.

ຫມາຍ​ເຫດ​ສໍາ​ຄັນ​: ໃນ​ເວ​ລາ​ທີ່​ການ​ປ່ຽນ​ຈາກ​ຮູບ​ແບບ lossy ເຊັ່ນ JPEG​, ຂໍ້​ມູນ​ຂອງ​
ການສູນເສຍແມ່ນສໍາຄັນ. ຜົນຜະລິດ DICOM ຈະມີຮູບພາບ Lossy ທີ່ຕ້ອງການ
ຄຸນ​ລັກ​ສະ​ນະ​ການ​ບີບ​ອັດ​ທີ່​ສະ​ແດງ​ໃຫ້​ເຫັນ​ວ່າ​ຮູບ​ພາບ​ໄດ້​ຮັບ​ການ​ສູນ​ເສຍ​ການ​ບີບ​ອັດ​ບາງ​ບ່ອນ​ຕາມ​
ທໍ່. ເບິ່ງ gdcmimg (ການຈັດການ JPEG ໂດຍທົ່ວໄປທີ່ດີກວ່າ).

ຫມາຍເຫດສໍາຄັນ: ເມື່ອໃຊ້ –use-vtkdicom ໄຟລ໌ DICOM ຜົນຜະລິດຈະຖືກຂຽນເປັນ.
ການເກັບຮັກສາຮູບພາບ MR ເນື່ອງຈາກຂໍ້ມູນນີ້ບໍ່ມີໃຫ້ຈາກຜູ້ອ່ານເອງ. ນີ້ອະນຸຍາດໃຫ້
ກໍານົດທິດທາງຮູບພາບ (ຄົນເຈັບ) ຢ່າງຖືກຕ້ອງ.

ໃຊ້ gdcm2vtk ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net