ນີ້ແມ່ນຄໍາສັ່ງ gmx-filter ທີ່ສາມາດດໍາເນີນການໄດ້ໃນ OnWorks ຜູ້ໃຫ້ບໍລິການໂຮດຕິ້ງຟຣີໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນຫຼາຍບ່ອນເຮັດວຽກອອນໄລນ໌ຂອງພວກເຮົາເຊັ່ນ Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator ຫຼື MAC OS online emulator
ໂຄງການ:
NAME
gmx-filter - ເສັ້ນທາງການກັ່ນຕອງຄວາມຖີ່, ເປັນປະໂຫຍດສໍາລັບການເຮັດໃຫ້ຮູບເງົາລຽບ
ສະຫຼຸບສັງລວມ
ການກັ່ນຕອງ gmx [-f [<.xtc/.trr/...>]] [-s [<.tpr/.gro/...>]] [-n [<.ndx>]]
[ບຸບເງິນ [<.xtc/.trr/...>]] [- ໂອ້ [<.xtc/.trr/...>]]
[-b ] [-e ] [-dt ] [-[ບໍ່]ວ] [-nf ]
[-[ບໍ່]ທັງໝົດ] [-[ບໍ່] nojump] [-[ບໍ່]ເຫມາະ]
ລາຍລະອຽດ
gmx ການກັ່ນຕອງ ປະຕິບັດການກັ່ນຕອງຄວາມຖີ່ໃນ trajectory. ຮູບຮ່າງຂອງການກັ່ນຕອງແມ່ນ cos(pi t/A)
+ 1 ຈາກ -A ຫາ +A, ບ່ອນທີ່ A ຖືກມອບໃຫ້ໂດຍທາງເລືອກ -nf ເວລາຂັ້ນຕອນເວລາໃນການປ້ອນຂໍ້ມູນ
ເສັ້ນທາງ. ການກັ່ນຕອງນີ້ຫຼຸດຜ່ອນການເຫນັງຕີງຂອງໄລຍະເວລາ A 85%, ໄລຍະເວລາ 2 * A 50%
ແລະມີໄລຍະເວລາ 3*A ໂດຍ 17% ສໍາລັບການກັ່ນຕອງຕ່ໍາຜ່ານ. ທັງ low-pass ແລະ high-pass ການກັ່ນຕອງ
trajectory ສາມາດຂຽນໄດ້.
ທາງເລືອກ ບຸບເງິນ ຂຽນ trajectory ການກັ່ນຕອງຕ່ໍາຜ່ານ. ກອບແມ່ນຂຽນທຸກ -nf ການປ້ອນຂໍ້ມູນ
ກອບ. ອັດຕາສ່ວນຂອງໄລຍະການກັ່ນຕອງແລະໄລຍະການຜະລິດໄດ້ຮັບປະກັນການສະກັດກັ້ນທີ່ດີຂອງ
aliasing ຂອງການເຄື່ອນໄຫວຄວາມຖີ່ສູງ, ເຊິ່ງເປັນປະໂຫຍດສໍາລັບການເຮັດໃຫ້ຮູບເງົາກ້ຽງ. ຍັງສະເລ່ຍ
ຄຸນສົມບັດທີ່ເປັນເສັ້ນຢູ່ໃນຈຸດປະສານງານແມ່ນຖືກຮັກສາໄວ້, ນັບຕັ້ງແຕ່ກອບການປ້ອນຂໍ້ມູນທັງໝົດ
ມີນ້ໍາຫນັກເທົ່າທຽມກັນໃນຜົນຜະລິດ. ໃນເວລາທີ່ກອບທັງຫມົດແມ່ນຈໍາເປັນ, ໃຊ້ -ທັງຫມົດ ທາງເລືອກ.
ທາງເລືອກ - ໂອ້ ຂຽນ trajectory ການກັ່ນຕອງຜ່ານສູງ. ລະດັບສູງຜ່ານການກັ່ນຕອງພິກັດແມ່ນ
ເພີ່ມໃສ່ຈຸດປະສານງານຈາກໄຟລ໌ໂຄງສ້າງ. ເມື່ອໃຊ້ການກັ່ນຕອງຜ່ານສູງໃຊ້ -ເຫມາະ
ຫຼືໃຫ້ແນ່ໃຈວ່າທ່ານໃຊ້ trajectory ທີ່ໄດ້ຮັບການປັບຕົວຢູ່ໃນຈຸດປະສານງານໃນໂຄງສ້າງ
ຍື່ນ.
OPTIONS
ທາງເລືອກໃນການລະບຸໄຟລ໌ປ້ອນຂໍ້ມູນ:
-f [<.xtc/.trr/...>] (traj.xtc)
ເສັ້ນທາງ: xtc tr cpt gro g96 pdb tng
-s [<.tpr/.gro/...>] (topol.tpr) (ຖ້າຕ້ອງການ)
ໂຄງສ້າງ+ມະຫາຊົນ(db): tpr gro g96 pdb brk ent
-n [<.ndx>] (index.ndx) (ຖ້າຕ້ອງການ)
ໄຟລ໌ດັດສະນີ
ທາງເລືອກໃນການລະບຸໄຟລ໌ຜົນຜະລິດ:
ບຸບເງິນ [<.xtc/.trr/...>] (lowpass.xtc) (ຖ້າຕ້ອງການ)
ເສັ້ນທາງ: xtc tr gro g96 pdb tng
- ໂອ້ [<.xtc/.trr/...>] (highpass.xtc) (ຖ້າຕ້ອງການ)
ເສັ້ນທາງ: xtc tr gro g96 pdb tng
ທາງເລືອກອື່ນ:
-b (0)
ກອບທໍາອິດ (ps) ອ່ານຈາກ trajectory
-e (0)
ກອບສຸດທ້າຍ (ps) ອ່ານຈາກ trajectory
-dt (0)
ໃຊ້ກອບພຽງແຕ່ເມື່ອ t MOD dt = ຄັ້ງທໍາອິດ (ps)
-[ບໍ່]ວ (ບໍ່ມີ)
ເບິ່ງຜົນຜະລິດ .xvg, .xpm, .eps ແລະ .pdb ໄຟ
-nf (10)
ກໍານົດຄວາມຍາວຂອງການກັ່ນຕອງເຊັ່ນດຽວກັນກັບໄລຍະຜົນຜະລິດສໍາລັບການກັ່ນຕອງຕ່ໍາຜ່ານ
-[ບໍ່]ທັງໝົດ (ບໍ່ມີ)
ຂຽນກອບທີ່ມີການກັ່ນຕອງຕ່ໍາທັງຫມົດ
-[ບໍ່] nojump (ແມ່ນແລ້ວ)
ເອົາການກະໂດດຂອງປະລໍາມະນູໃນທົ່ວກ່ອງ
-[ບໍ່]ເຫມາະ (ບໍ່ມີ)
ພໍດີທຸກກອບກັບໂຄງສ້າງອ້າງອີງ
ໃຊ້ gmx-filter ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net
