mia-2dmyomilles - ອອນລາຍໃນຄລາວ

ໂຄງການ:

NAME

mia-2dmyomilles - ດໍາເນີນການລົງທະບຽນຊຸດຂອງຮູບພາບ 2D.

ສະຫຼຸບສັງລວມ

mia-2dmyomilles -i -o [ທາງເລືອກ]

ລາຍລະອຽດ

mia-2dmyomilles ໂຄງການນີ້ແມ່ນໃຊ້ເພື່ອດໍາເນີນການສະບັບດັດແກ້ຂອງ ICA ອີງໃສ່
ວິທີການລົງທະບຽນທີ່ອະທິບາຍໄວ້ໃນ Milles et al. 'ການແກ້ໄຂການເຄື່ອນໄຫວອັດຕະໂນມັດຢ່າງເຕັມສ່ວນໃນ
First-Pass Myocardial Perfusion MR Image Sequences ', Trans. Med. ຮູບພາບ., 27(11)
1611-1621, 2008. ການປ່ຽນແປງລວມເຖິງການສະກັດເອົາການເຄື່ອນໄຫວ quasi-periodic ໃນຟຣີ
ຊຸດຂໍ້ມູນທີ່ໄດ້ມາໂດຍຫາຍໃຈ ແລະທາງເລືອກທີ່ຈະດໍາເນີນການລົງທະບຽນແບບ affine ຫຼື rigid ແທນ
ຂອງການເພີ່ມປະສິດທິພາບການແປພາສາເທົ່ານັ້ນ.

OPTIONS

ໄຟລ໌-IO
-i --in-file=(ການປ້ອນຂໍ້ມູນ, ຕ້ອງການ); ສາຍ
ຊຸດຂໍ້ມູນ input perfusion

-o --out-file=(ອອກ, ຕ້ອງການ); ສາຍ
ຜົນຜະລິດຊຸດຂໍ້ມູນ perfusion

-r --ລົງທະບຽນ=
ຖານຊື່ໄຟລ໌ສໍາລັບໄຟລ໌ທີ່ລົງທະບຽນ

--save-references=
ບັນທຶກຮູບພາບອ້າງອີງສັງເຄາະໃສ່ຖານໄຟລ໌ນີ້

--save-cropped=
ບັນ​ທຶກ​ຮູບ​ພາບ​ທີ່​ຖືກ​ຕັດ​ຕັ້ງ​ເປັນ​ໄຟລ​໌​ນີ້​

--save-feature=
ບັນທຶກຮູບພາບຄຸນສົມບັດທີ່ເປັນຜົນມາຈາກ ICA ແລະບາງຮູບພາບລະດັບປານກາງ
ໃຊ້ສໍາລັບການແບ່ງສ່ວນ RV-LV ທີ່ມີພື້ນຖານຊື່ໄຟລ໌ໃຫ້ກັບໄຟລ໌ PNG.
ຍັງປະຫຍັດຄ່າສໍາປະສິດຂອງເບື້ອງຕົ້ນທີ່ດີທີ່ສຸດແລະການຜະສົມ IC ສຸດທ້າຍ
ມາຕຣິກເບື້ອງ.

ຊ່ວຍເຫຼືອ & ຂໍ້ມູນ
-V --verbose=ຄຳ​ເຕືອນ
verbosity ຂອງ​ຜົນ​ຜະ​ລິດ​, ພິມ​ຂໍ້​ຄວາມ​ຂອງ​ລະ​ດັບ​ທີ່​ໄດ້​ຮັບ​ແລະ​ບູ​ລິ​ມະ​ສິດ​ສູງ​ກວ່າ​.
ບຸລິມະສິດທີ່ສະໜັບສະໜູນໂດຍເລີ່ມຈາກລະດັບຕໍ່າສຸດແມ່ນ:
ຂໍ້ມູນ - ຂໍ້​ຄວາມ​ໃນ​ລະ​ດັບ​ຕ​່​ໍ​າ​
trace - Function ໂທຕິດຕາມ
ບໍ່ - ລາຍ​ງານ​ຄວາມ​ລົ້ມ​ເຫຼວ​ຂອງ​ການ​ທົດ​ສອບ​
ການເຕືອນໄພ - ຄໍາ​ເຕືອນ​
ຄວາມຜິດພາດ - ລາຍ​ງານ​ຄວາມ​ຜິດ​ພາດ​
debug - ຜົນ​ຜະ​ລິດ​ແກ້​ໄຂ​ບັນ​ຫາ​
ຂໍ້ຄວາມ - ຂໍ້​ຄວາມ​ປົກ​ກະ​ຕິ​
ຄວາມຕາຍ - ລາຍ​ງານ​ຄວາມ​ຜິດ​ພາດ​ຕາຍ​ເທົ່າ​ນັ້ນ​

--ລິຂະສິດ
ພິມຂໍ້ມູນລິຂະສິດ

-h --help
ພິມການຊ່ວຍເຫຼືອນີ້

- ? -- ການ​ນໍາ​ໃຊ້​
ພິມການຊ່ວຍເຫຼືອສັ້ນ

- ການປ່ຽນແປງ
ພິມຕົວເລກສະບັບແລະອອກ

ICE
-C --ສ່ວນປະກອບ=0
ອົງປະກອບ ICA 0 = ການຄາດຄະເນອັດຕະໂນມັດ ອົງປະກອບ ICA 0 = ອັດຕະໂນມັດ
ການຄາດຄະເນ

-- ປົກກະຕິ
ICs ປົກກະຕິ

-- ບໍ່ມີທາງອອກ
ຢ່າເອົາຄ່າສະເລ່ຍອອກຈາກເສັ້ນໂຄ້ງປະສົມ

-g --ເດົາ
ໃຊ້ການຄາດເດົາເບື້ອງຕົ້ນສໍາລັບການ perfusion myocardial

-s --segscale=1.4
segment and scale the crop box around the LV (0=no segmentation)segment and
ຂະຫຍາຍກ່ອງຕັດຮອບ LV (0=ບໍ່ມີການແບ່ງສ່ວນ)

-k --ຂ້າມ=0
ຂ້າມຮູບພາບໃນຕອນຕົ້ນຂອງຊຸດຍ້ອນວ່າພວກມັນເປັນຂອງອື່ນໆ
modalities ຂ້າມຮູບພາບໃນຕອນຕົ້ນຂອງຊຸດຍ້ອນວ່າພວກມັນເປັນຂອງອື່ນໆ
ແບບແຜນ

-m --max-ica-iter=400
ຈໍາ​ນວນ​ສູງ​ສຸດ​ຂອງ iterations ໃນ ICA ຈໍາ​ນວນ​ສູງ​ສຸດ​ຂອງ iterations ໃນ ICA​

-E --segmethod=ຄຸນສົມບັດ
ວິທີການແບ່ງສ່ວນ
delta-ສູງສຸດ - ຄວາມ​ແຕກ​ຕ່າງ​ຂອງ​ຮູບ​ພາບ​ການ​ປັບ​ປຸງ​ສູງ​ສຸດ​
ຄຸນ​ລັກ​ສະ​ນະ - ຮູບ​ພາບ​ຄຸນ​ນະ​ສົມ​ບັດ​
ລັກສະນະ delta - ຄວາມ​ແຕກ​ຕ່າງ​ຂອງ​ຮູບ​ພາບ​ຄຸນ​ນະ​ສົມ​ບັດ​

ການປະມວນຜົນ
--ກະທູ້=-1
ຈໍາ​ນວນ​ສູງ​ສຸດ​ຂອງ​ກະ​ທູ້​ທີ່​ຈະ​ນໍາ​ໃຊ້​ສໍາ​ລັບ​ການ​ປຸງ​ແຕ່ງ​, ຈໍາ​ນວນ​ນີ້​ຄວນ​ຈະ​ຕ​່​ໍ​າ​
ຫຼືເທົ່າກັບຈໍານວນຂອງແກນໂຮງງານຜະລິດຕາມເຫດຜົນໃນເຄື່ອງ. (-1:
ການ​ຄາດ​ຄະ​ເນ​ອັດ​ຕະ​ໂນ​ມັດ​)​.​ຈໍາ​ນວນ​ສູງ​ສຸດ​ຂອງ​ກະ​ທູ້​ທີ່​ຈະ​ນໍາ​ໃຊ້​ສໍາ​ລັບ​ການ​ປຸງ​ແຕ່ງ​, ນີ້​
ຈໍາ​ນວນ​ຄວນ​ຈະ​ຕ​່​ໍ​າ​ຫຼື​ເທົ່າ​ທຽມ​ກັບ​ຈໍາ​ນວນ​ຂອງ​ຫຼັກ​ການ​ປະ​ມວນ​ຜົນ​ທີ່​ມີ​ເຫດ​ຜົນ​ໃນ​
ເຄື່ອງ. (-1: ການຄາດຄະເນອັດຕະໂນມັດ).

ການລົງທະບຽນ
-c --cost=ssd
ເງື່ອນໄຂການລົງທະບຽນ

-O --optimizer=gsl:opt=simplex,step=1.0
Optimizer ໃຊ້ສໍາລັບ minimizationOptimizer ໃຊ້ສໍາລັບ minimization For
ປລັກອິນທີ່ຮອງຮັບເບິ່ງ PLUGINS:minimizer/singlecost

-f --transForm=rigid
ການຫັນປ່ຽນ typetransformation type ສໍາລັບ plugins ສະຫນັບສະຫນູນເບິ່ງ
Plugins: 2dimage/transform

-l --mg-levels=3
ຫຼາຍລະດັບຄວາມລະອຽດຫຼາຍລະດັບ

-R --reference=-1
ການອ້າງອິງທົ່ວໂລກຮູບພາບທັງຫມົດຄວນຈະຖືກຈັດໃສ່ກັບ. ຖ້າຕັ້ງເປັນທີ່ບໍ່ແມ່ນລົບ
ມູນຄ່າ, ຮູບພາບຕ່າງໆຈະຖືກສອດຄ່ອງກັບການອ້າງອີງນີ້, ແລະຜົນຜະລິດທີ່ຖືກຕັດອອກ
ວັນທີຂອງຮູບພາບຈະຖືກສີດເຂົ້າໄປໃນຮູບພາບຕົ້ນສະບັບ. ອອກຈາກ -1 ຖ້າທ່ານ
ບໍ່ສົນໃຈ. ໃນ​ກໍ​ລະ​ນີ​ນີ້​ຮູບ​ພາບ​ທັງ​ຫມົດ​ທີ່​ມີ​ການ​ຈົດ​ທະ​ບຽນ​ກັບ​ຕໍາ​ແຫນ່ງ​ສະ​ເລ່ຍ​ຂອງ​
ການ​ເຄື່ອນ​ໄຫວ​ກະ​ສານ​ອ້າງ​ອີງ​ທົ່ວ​ໂລກ​ຮູບ​ພາບ​ທັງ​ຫມົດ​ຄວນ​ຈະ​ສອດ​ຄ່ອງ​ກັບ​. ຖ້າຕັ້ງເປັນ ກ
ມູນຄ່າທີ່ບໍ່ແມ່ນທາງລົບ, ຮູບພາບຕ່າງໆຈະຖືກສອດຄ່ອງກັບການອ້າງອີງນີ້, ແລະ
ວັນທີຮູບພາບຜົນຜະລິດທີ່ຖືກຕັດຈະຖືກສີດເຂົ້າໄປໃນຮູບພາບຕົ້ນສະບັບ. ອອກໄປ
ຢູ່ທີ່ -1 ຖ້າທ່ານບໍ່ສົນໃຈ. ໃນ​ກໍ​ລະ​ນີ​ນີ້​ຮູບ​ພາບ​ທັງ​ຫມົດ​ທີ່​ມີ​ການ​ລົງ​ທະ​ບຽນ a
ຕໍາແຫນ່ງສະເລ່ຍຂອງການເຄື່ອນໄຫວ

-P --passes=2
ການລົງທະບຽນ passesregistration passes

ປລັກອິນ: 1d/splinebc

mirror Spline interpolation ເງື່ອນໄຂຂອບເຂດຊາຍແດນທີ່ສະທ້ອນກ່ຽວກັບເຂດແດນ

(ບໍ່ມີຕົວກໍານົດການ)

ຊ້ໍາ Spline interpolation ເງື່ອນ​ໄຂ​ເຂດ​ແດນ​ທີ່​ເຮັດ​ເລ​ື້ມ​ຄືນ​ຄ່າ​ຢູ່​ໃນ​ຂອບ​ເຂດ​

(ບໍ່ມີຕົວກໍານົດການ)

ສູນ Spline interpolation ເງື່ອນໄຂຂອບເຂດທີ່ສົມມຸດເປັນສູນສໍາລັບຄ່າພາຍນອກ

(ບໍ່ມີຕົວກໍານົດການ)

ປລັກອິນ: 1d/splinekernel

bspline ການສ້າງ kernel B-spline, ຕົວກໍານົດການທີ່ສະຫນັບສະຫນູນແມ່ນ:

d = 3; int ໃນ [0, 5]
ລະດັບ Spline.

omoms OMoms-spline kernel ສ້າງ, ຕົວກໍານົດການທີ່ສະຫນັບສະຫນູນແມ່ນ:

d = 3; int ໃນ [3, 3]
ລະດັບ Spline.

ປລັກອິນ: 2dimage/ການຫັນເປັນ

ຄວາມກັງວົນ ການ​ຫັນ​ປ່ຽນ Affine (ຫົກ​ອົງ​ສາ​ຂອງ​ອິດ​ສະ​ຫຼະ​)​, ຕົວ​ກໍາ​ນົດ​ການ​ສະ​ຫນັບ​ສະ​ຫນູນ​ແມ່ນ​:

ເຂດແດນ = ກະຈົກ; ໂຮງງານ
ຮູບ​ພາບ​ເງື່ອນ​ໄຂ​ເຂດ​ແດນ interpolation​. ສໍາລັບ plug-ins ສະຫນັບສະຫນູນເບິ່ງ
ປລັກອິນ: 1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; ໂຮງງານ
ຮູບ​ພາບ interpolator kernel​. ສໍາລັບ plug-ins ສະຫນັບສະຫນູນເບິ່ງ
Plugins:1d/splinekernel

rigid ການຫັນເປັນແຂງ (ie ພືດຫມູນວຽນແລະການແປ, ສາມອົງສາຂອງ
ອິດສະລະພາບ), ຕົວກໍານົດການທີ່ສະຫນັບສະຫນູນແມ່ນ:

ເຂດແດນ = ກະຈົກ; ໂຮງງານ
ຮູບ​ພາບ​ເງື່ອນ​ໄຂ​ເຂດ​ແດນ interpolation​. ສໍາລັບ plug-ins ສະຫນັບສະຫນູນເບິ່ງ
ປລັກອິນ: 1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; ໂຮງງານ
ຮູບ​ພາບ interpolator kernel​. ສໍາລັບ plug-ins ສະຫນັບສະຫນູນເບິ່ງ
Plugins:1d/splinekernel

ເນົ່າເປື່ອຍສູນກາງ = [[0,0]]; 2dfvector
ສູນ rotation ພີ່ນ້ອງ, ie <0.5,0.5> ກົງກັບສູນກາງຂອງ.
ສະ​ຫນັບ​ສະ​ຫນູນ​ຮູບ​ສີ່​ແຈ​ສາກ​.

ພືດຫມູນວຽນ ການຫັນເປັນພືດຫມູນວຽນ (ie ພືດຫມູນວຽນກ່ຽວກັບສູນກາງໃດຫນຶ່ງ, ຫນຶ່ງລະດັບຂອງ
ອິດສະລະພາບ), ຕົວກໍານົດການທີ່ສະຫນັບສະຫນູນແມ່ນ:

ເຂດແດນ = ກະຈົກ; ໂຮງງານ
ຮູບ​ພາບ​ເງື່ອນ​ໄຂ​ເຂດ​ແດນ interpolation​. ສໍາລັບ plug-ins ສະຫນັບສະຫນູນເບິ່ງ
ປລັກອິນ: 1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; ໂຮງງານ
ຮູບ​ພາບ interpolator kernel​. ສໍາລັບ plug-ins ສະຫນັບສະຫນູນເບິ່ງ
Plugins:1d/splinekernel

ເນົ່າເປື່ອຍສູນກາງ = [[0,0]]; 2dfvector
ສູນ rotation ພີ່ນ້ອງ, ie <0.5,0.5> ກົງກັບສູນກາງຂອງ.
ສະ​ຫນັບ​ສະ​ຫນູນ​ຮູບ​ສີ່​ແຈ​ສາກ​.

spline ການຫັນປ່ຽນຮູບແບບຟຣີທີ່ສາມາດອະທິບາຍໄດ້ໂດຍຊຸດຂອງຕົວຄູນ B-spline
ແລະພື້ນຖານ B-spline kernel., ຕົວກໍານົດການທີ່ສະຫນັບສະຫນູນແມ່ນ:

ກະຕຸ້ນ = [[0,0]]; 2dfvector
ອັດຕາຄ່າສໍາປະສິດ anisotropic ໃນ pixels, ຄ່າທີ່ບໍ່ແມ່ນບວກຈະເປັນ
ຂຽນທັບໂດຍຄ່າ 'ອັດຕາ'..

ເຂດແດນ = ກະຈົກ; ໂຮງງານ
ຮູບ​ພາບ​ເງື່ອນ​ໄຂ​ເຂດ​ແດນ interpolation​. ສໍາລັບ plug-ins ສະຫນັບສະຫນູນເບິ່ງ
ປລັກອິນ: 1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; ໂຮງງານ
ຮູບ​ພາບ interpolator kernel​. ສໍາລັບ plug-ins ສະຫນັບສະຫນູນເບິ່ງ
Plugins:1d/splinekernel

kernel = [bspline:d=3]; ໂຮງງານ
transformation spline kernel.. ສໍາລັບ plug-ins ທີ່ຮອງຮັບເບິ່ງ
Plugins:1d/splinekernel

ໂທດ = ; ໂຮງງານ
ໄລຍະການລົງໂທດການຫັນປ່ຽນ. ສໍາລັບ plug-ins ສະຫນັບສະຫນູນເບິ່ງ
Plugins: 2dtransform/splinepenalty

ອັດຕາການ = 10; ລອຍຢູ່ໃນ [1, inf)
ອັດຕາຄ່າສໍາປະສິດ isotropic ເປັນ pixels.

ແປພາສາ ການແປພາສາເທົ່ານັ້ນ (ສອງລະດັບເສລີພາບ), ຕົວກໍານົດການທີ່ສະຫນັບສະຫນູນແມ່ນ:

ເຂດແດນ = ກະຈົກ; ໂຮງງານ
ຮູບ​ພາບ​ເງື່ອນ​ໄຂ​ເຂດ​ແດນ interpolation​. ສໍາລັບ plug-ins ສະຫນັບສະຫນູນເບິ່ງ
ປລັກອິນ: 1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; ໂຮງງານ
ຮູບ​ພາບ interpolator kernel​. ສໍາລັບ plug-ins ສະຫນັບສະຫນູນເບິ່ງ
Plugins:1d/splinekernel

vf ປັ໊ກອິນນີ້ປະຕິບັດການຫັນປ່ຽນທີ່ກໍານົດການແປພາສາສໍາລັບແຕ່ລະຄົນ
ຈຸດຂອງຕາຂ່າຍໄຟຟ້າກໍານົດໂດເມນຂອງການຫັນເປັນ., ສະຫນັບສະຫນູນ
ຕົວກໍານົດການແມ່ນ:

ເຂດແດນ = ກະຈົກ; ໂຮງງານ
ຮູບ​ພາບ​ເງື່ອນ​ໄຂ​ເຂດ​ແດນ interpolation​. ສໍາລັບ plug-ins ສະຫນັບສະຫນູນເບິ່ງ
ປລັກອິນ: 1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; ໂຮງງານ
ຮູບ​ພາບ interpolator kernel​. ສໍາລັບ plug-ins ສະຫນັບສະຫນູນເບິ່ງ
Plugins:1d/splinekernel

ປລັກອິນ: 2dtransform/splinepenalty

divcurl ການລົງໂທດ divcurl ກ່ຽວກັບການຫັນປ່ຽນ, ຕົວກໍານົດການສະຫນັບສະຫນູນແມ່ນ:

curl = 1; ລອຍຢູ່ໃນ [0, inf)
ນ້ໍາຫນັກການລົງໂທດກ່ຽວກັບ curl.

div = 1; ລອຍຢູ່ໃນ [0, inf)
ນ້ຳໜັກການລົງໂທດກ່ຽວກັບຄວາມແຕກຕ່າງ.

ມາດຕະຖານ = 0; ບູລ
ກໍານົດເປັນ 1 ຖ້າຫາກວ່າການລົງໂທດຄວນຈະເປັນປົກກະຕິກ່ຽວກັບຮູບພາບ
ຂະຫນາດ.

ນ້ໍາ = 1; ລອຍຢູ່ໃນ (0, inf)
ນ້ໍາຫນັກຂອງພະລັງງານການລົງໂທດ.

ປລັກອິນ: minimizer/singlecost

gdas Gradient descent ດ້ວຍການແກ້ໄຂຂະໜາດຂັ້ນຕອນອັດຕະໂນມັດ., ຕົວກໍານົດການທີ່ຮອງຮັບແມ່ນ:

ftolr = 0; ສອງເທົ່າໃນ [0, inf)
ຢຸດເຊົາຖ້າການປ່ຽນແປງຂອງເງື່ອນໄຂແມ່ນຂ້າງລຸ່ມນີ້..

ຂັ້ນ​ຕອນ​ສູງ​ສຸດ​ = 2; double in (0, inf)
ຂະຫນາດຂັ້ນຕອນຢ່າງແທ້ຈິງສູງສຸດ.

maxiter = 200; uint ໃນ [1, inf)
ເກນການຢຸດ: ຈຳນວນສູງສຸດຂອງການເຮັດຊ້ຳ.

ຂັ້ນຕອນນາທີ = 0.1; double in (0, inf)
ຂະຫນາດຂັ້ນຕອນຢ່າງແທ້ຈິງຫນ້ອຍທີ່ສຸດ.

xtola = 0.01; ສອງເທົ່າໃນ [0, inf)
ຢຸດຖ້າ inf-norm ຂອງການປ່ຽນແປງທີ່ໃຊ້ກັບ x ແມ່ນຕໍ່າກວ່າຄ່ານີ້..

gdsq Gradient descent ດ້ວຍການປະເມີນຂັ້ນຕອນສີ່ຫຼ່ຽມ, ຕົວກໍານົດການທີ່ຮອງຮັບແມ່ນ:

ftolr = 0; ສອງເທົ່າໃນ [0, inf)
ຢຸດເຊົາຖ້າການປ່ຽນແປງຂອງເງື່ອນໄຂແມ່ນຂ້າງລຸ່ມນີ້..

gtola = 0; ສອງເທົ່າໃນ [0, inf)
ຢຸດຖ້າ inf-norm ຂອງ gradient ຕ່ຳກວ່າຄ່ານີ້..

maxiter = 100; uint ໃນ [1, inf)
ເກນການຢຸດ: ຈຳນວນສູງສຸດຂອງການເຮັດຊ້ຳ.

ຂະຫນາດ = 2; double in (1, inf)
Fallback ການປັບຂະຫນາດຂັ້ນຕອນຄົງທີ່.

ຂັ້ນ​ຕອນ = 0.1; double in (0, inf)
ຂະ​ຫນາດ​ຂັ້ນ​ຕອນ​ຕົ້ນ​.

xtola = 0; ສອງເທົ່າໃນ [0, inf)
ຢຸດຖ້າ inf-norm ຂອງ x-update ຕໍ່າກວ່າຄ່ານີ້..

gsl plugin optimizer ອີງໃສ່ multimin optimizers ຂອງຫ້ອງສະຫມຸດວິທະຍາສາດ GNU
(GSL) https://www.gnu.org/software/gsl/, ຕົວກໍານົດການທີ່ຮອງຮັບແມ່ນ:

eps = 0.01; double in (0, inf)
gradient based optimizers: ຢຸດເມື່ອ |grad| < eps, simplex: ຢຸດເມື່ອ
ຂະໜາດ simplex < eps..

ເຮັດຊ້ຳ = 100; uint ໃນ [1, inf)
ຈໍານວນການຊໍ້າຄືນສູງສຸດ.

ເລືອກ = gd; ຄຳສັ່ງ
ການເພີ່ມປະສິດທິພາບສະເພາະທີ່ຈະໃຊ້.. ຄ່າທີ່ຮອງຮັບແມ່ນ:
bfgs - Broyden-Fletcher-Goldfarb-Shann
bfgs2 - Broyden-Fletcher-Goldfarb-Shann (ສະບັບທີ່ມີປະສິດທິພາບທີ່ສຸດ)
cg-fr - Flecher-Reeves conjugate algorithm gradient
gd - ການ​ສືບ​ເຊື້ອ​ສາຍ Gradient​.
Simplex - ສູດການຄິດໄລ່ທີ່ງ່າຍດາຍຂອງ Nelder ແລະ Mead
cg-pr - Polak-Ribiere conjugate algorithm gradient

ຂັ້ນ​ຕອນ = 0.001; double in (0, inf)
ຂະ​ຫນາດ​ຂັ້ນ​ຕອນ​ຕົ້ນ​.

ຊຸກຍູ້ = 0.1; double in (0, inf)
ຕົວກໍານົດການຄວາມທົນທານບາງ.

nlopt ຂັ້ນ​ຕອນ​ການ​ຫຼຸດ​ຜ່ອນ​ການ​ນໍາ​ໃຊ້​ຫ້ອງ​ສະ​ຫມຸດ NLOPT​, ສໍາ​ລັບ​ລາຍ​ລະ​ອຽດ​ຂອງ​
optimizers ກະລຸນາເບິ່ງ 'http://ab-
initio.mit.edu/wiki/index.php/NLopt_Algorithms ', ຕົວກໍານົດການທີ່ສະຫນັບສະຫນູນແມ່ນ:

ftola = 0; ສອງເທົ່າໃນ [0, inf)
ເງື່ອນໄຂການຢຸດເຊົາ: ການປ່ຽນແປງຢ່າງແທ້ຈິງຂອງມູນຄ່າຈຸດປະສົງຂ້າງລຸ່ມນີ້
ຄ່ານີ້.

ftolr = 0; ສອງເທົ່າໃນ [0, inf)
ເງື່ອນໄຂການຢຸດເຊົາ: ການປ່ຽນແປງທີ່ກ່ຽວຂ້ອງຂອງມູນຄ່າຈຸດປະສົງຂ້າງລຸ່ມນີ້
ຄ່ານີ້.

ສູງ = inf; ສອງເທົ່າ
ຂອບເຂດທີ່ສູງກວ່າ (ເທົ່າກັບພາລາມິເຕີທັງໝົດ).

local-opt = none; ຄຳສັ່ງ
ຂັ້ນຕອນການຫຼຸດຜ່ອນທ້ອງຖິ່ນທີ່ອາດຈະຕ້ອງການສໍາລັບຕົ້ນຕໍ
ຂັ້ນຕອນການຫຼຸດຫນ້ອຍລົງ.. ຄ່າທີ່ຮອງຮັບແມ່ນ:
gn-orig-direct-l - ການ​ແບ່ງ​ປັນ​ຮູບ​ສີ່​ແຈ​ສາກ (ການ​ປະ​ຕິ​ບັດ​ຕົ້ນ​ສະ​ບັບ​,
ລຳອຽງໃນທ້ອງຖິ່ນ)
gn-direct-l-noscal - ການ​ແບ່ງ​ປັນ​ຮູບ​ສີ່​ແຈ​ສາກ (ບໍ່​ໄດ້​ຂະ​ຫຍາຍ​, ລໍາ​ອຽງ​ໃນ​ທ້ອງ​ຖິ່ນ​)
gn-isres - ປັບປຸງຍຸດທະສາດການວິວັດທະນາການຈັດອັນດັບ Stochastic
ld-tnewton - ຕັດນິວຕັນ
gn-direct-l-rand - ການ​ແບ່ງ​ປັນ​ຮູບ​ສີ່​ແຈ​ສາກ (ອະ​ຄະ​ຕິ​ໃນ​ທ້ອງ​ຖິ່ນ​, Random​)
ln-newuoa - ການເພີ່ມປະສິດທິພາບແບບບໍ່ມີຂໍ້ຈຳກັດແບບອະນຸພັນແບບບໍ່ມີຂໍ້ຈຳກັດໂດຍການເຮັດຊ້ຳ
ການກໍ່ສ້າງປະມານສີ່ຫລ່ຽມ
gn-direct-l-rand-noscale - ການ​ແບ່ງ​ປັນ​ຮູບ​ສີ່​ແຈ​ສາກ (ບໍ່​ມີ​ຂະ​ຫນາດ​, ໃນ​ທ້ອງ​ຖິ່ນ​
ລຳອຽງ, ແບບສຸ່ມ)
gn-orig-direct - ການ​ແບ່ງ​ປັນ​ຮູບ​ສີ່​ແຈ​ສາກ (ການ​ປະ​ຕິ​ບັດ​ຕົ້ນ​ສະ​ບັບ​)
ld-tnewton-precond - Preconditioned Truncated Newton
ld-tnewton-restart - ຕັດນິວຕັນດ້ວຍການເລີ່ມຕົ້ນໃໝ່ທີ່ຊັນທີ່ສຸດ
gn-ໂດຍກົງ - ການ​ແບ່ງ​ປັນ​ຮູບ​ສີ່​ແຈ​ສາກ​
ln-neldermead - ສູດການຄິດໄລ່ Nelder-Mead simplex
ln-cobyla - ການເພີ່ມປະສິດທິພາບແບບຈຳກັດໂດຍການປະມານເສັ້ນຊື່
gn-crs2-lm - ການ​ຄວບ​ຄຸມ​ການ​ຊອກ​ຫາ Random ກັບ​ການ​ປ່ຽນ​ແປງ​ທ້ອງ​ຖິ່ນ​
ld-var2 - Shifted Limited-Memory Variable-Metric, ອັນດັບ 2
ld-var1 - Shifted Limited-Memory Variable-Metric, ອັນດັບ 1
ld-mma - ວິ​ທີ​ການ​ຍ້າຍ Asymptotes​
ld-lbfgs-nocedal - ບໍ່ມີ
ld-lbfgs - BFGS ການ​ເກັບ​ຮັກ​ສາ​ຕ​່​ໍ​າ​
gn-direct-l - ການ​ແບ່ງ​ປັນ​ຮູບ​ສີ່​ແຈ​ສາກ (ອະ​ຄະ​ຕິ​ໃນ​ທ້ອງ​ຖິ່ນ​)
none - ບໍ່​ລະ​ບຸ​ລະ​ບຽບ​ການ​
ln-bobyqa - ການເພີ່ມປະສິດທິພາບທີ່ບໍ່ມີຂອບເຂດຈໍາກັດ Derivative-free
ln-sbplx - ຕົວແປຍ່ອຍຂອງ Nelder-Mead
ln-newuoa-bound - Derivative-free Bound-constrained Optimization ໂດຍ
ປະມານສີ່ຫຼ່ຽມທີ່ສ້າງຂຶ້ນຊ້ຳໆ
ln-praxis - ການເພີ່ມປະສິດທິພາບໃນທ້ອງຖິ່ນທີ່ບໍ່ມີການປ່ຽນສີຜ່ານ Principal-Axis
ວິທີການ
gn-direct-noscal - ການ​ແບ່ງ​ປັນ​ຮູບ​ສີ່​ແຈ​ສາກ (ບໍ່​ໄດ້​ຂະ​ຫຍາຍ​)
ld-tnewton-precond-restart - Preconditioned Truncated Newton ກັບ
restarting steepest-descent

ຕ່ໍາ = -inf; ສອງເທົ່າ
ຂອບເຂດຕ່ໍາ (ເທົ່າກັບພາລາມິເຕີທັງຫມົດ).

maxiter = 100; int ໃນ [1, inf)
ເກນການຢຸດ: ຈຳນວນສູງສຸດຂອງການເຮັດຊ້ຳ.

ເລືອກ = ld-lbfgs; ຄຳສັ່ງ
ຂັ້ນຕອນການຫຼຸດຜ່ອນຕົ້ນຕໍ. ຄ່າ​ທີ່​ສະ​ຫນັບ​ສະ​ຫນູນ​ແມ່ນ​:
gn-orig-direct-l - ການ​ແບ່ງ​ປັນ​ຮູບ​ສີ່​ແຈ​ສາກ (ການ​ປະ​ຕິ​ບັດ​ຕົ້ນ​ສະ​ບັບ​,
ລຳອຽງໃນທ້ອງຖິ່ນ)
g-mlsl-lds - ຫຼາຍ​ລະ​ດັບ​ການ​ເຊື່ອມ​ຕໍ່​ດຽວ (ລໍາ​ດັບ​ຄວາມ​ແຕກ​ຕ່າງ​ຕ​່​ໍ​າ​,
ຕ້ອງການການເພີ່ມປະສິດທິພາບໂດຍອີງໃສ່ gradient ທ້ອງຖິ່ນແລະຂອບເຂດ)
gn-direct-l-noscal - ການ​ແບ່ງ​ປັນ​ຮູບ​ສີ່​ແຈ​ສາກ (ບໍ່​ໄດ້​ຂະ​ຫຍາຍ​, ລໍາ​ອຽງ​ໃນ​ທ້ອງ​ຖິ່ນ​)
gn-isres - ປັບປຸງຍຸດທະສາດການວິວັດທະນາການຈັດອັນດັບ Stochastic
ld-tnewton - ຕັດນິວຕັນ
gn-direct-l-rand - ການ​ແບ່ງ​ປັນ​ຮູບ​ສີ່​ແຈ​ສາກ (ອະ​ຄະ​ຕິ​ໃນ​ທ້ອງ​ຖິ່ນ​, Random​)
ln-newuoa - ການເພີ່ມປະສິດທິພາບແບບບໍ່ມີຂໍ້ຈຳກັດແບບອະນຸພັນແບບບໍ່ມີຂໍ້ຈຳກັດໂດຍການເຮັດຊ້ຳ
ການກໍ່ສ້າງປະມານສີ່ຫລ່ຽມ
gn-direct-l-rand-noscale - ການ​ແບ່ງ​ປັນ​ຮູບ​ສີ່​ແຈ​ສາກ (ບໍ່​ມີ​ຂະ​ຫນາດ​, ໃນ​ທ້ອງ​ຖິ່ນ​
ລຳອຽງ, ແບບສຸ່ມ)
gn-orig-direct - ການ​ແບ່ງ​ປັນ​ຮູບ​ສີ່​ແຈ​ສາກ (ການ​ປະ​ຕິ​ບັດ​ຕົ້ນ​ສະ​ບັບ​)
ld-tnewton-precond - Preconditioned Truncated Newton
ld-tnewton-restart - ຕັດນິວຕັນດ້ວຍການເລີ່ມຕົ້ນໃໝ່ທີ່ຊັນທີ່ສຸດ
gn-ໂດຍກົງ - ການ​ແບ່ງ​ປັນ​ຮູບ​ສີ່​ແຈ​ສາກ​
auglag-eq - ສູດການຄິດໄລ່ Lagrangian ເພີ່ມຂຶ້ນທີ່ມີຂໍ້ຈໍາກັດຄວາມສະເຫມີພາບ
ພຽງແຕ່
ln-neldermead - ສູດການຄິດໄລ່ Nelder-Mead simplex
ln-cobyla - ການເພີ່ມປະສິດທິພາບແບບຈຳກັດໂດຍການປະມານເສັ້ນຊື່
gn-crs2-lm - ການ​ຄວບ​ຄຸມ​ການ​ຊອກ​ຫາ Random ກັບ​ການ​ປ່ຽນ​ແປງ​ທ້ອງ​ຖິ່ນ​
ld-var2 - Shifted Limited-Memory Variable-Metric, ອັນດັບ 2
ld-var1 - Shifted Limited-Memory Variable-Metric, ອັນດັບ 1
ld-mma - ວິ​ທີ​ການ​ຍ້າຍ Asymptotes​
ld-lbfgs-nocedal - ບໍ່ມີ
g-mlsl - ການເຊື່ອມໂຍງແບບດຽວຫຼາຍລະດັບ (ຕ້ອງການການເພີ່ມປະສິດທິພາບໃນທ້ອງຖິ່ນແລະ
ຂອບເຂດ)
ld-lbfgs - BFGS ການ​ເກັບ​ຮັກ​ສາ​ຕ​່​ໍ​າ​
gn-direct-l - ການ​ແບ່ງ​ປັນ​ຮູບ​ສີ່​ແຈ​ສາກ (ອະ​ຄະ​ຕິ​ໃນ​ທ້ອງ​ຖິ່ນ​)
ln-bobyqa - ການເພີ່ມປະສິດທິພາບທີ່ບໍ່ມີຂອບເຂດຈໍາກັດ Derivative-free
ln-sbplx - ຕົວແປຍ່ອຍຂອງ Nelder-Mead
ln-newuoa-bound - Derivative-free Bound-constrained Optimization ໂດຍ
ປະມານສີ່ຫຼ່ຽມທີ່ສ້າງຂຶ້ນຊ້ຳໆ
auglag - ສູດການຄິດໄລ່ Lagrangian ເພີ່ມຂຶ້ນ
ln-praxis - ການເພີ່ມປະສິດທິພາບໃນທ້ອງຖິ່ນທີ່ບໍ່ມີການປ່ຽນສີຜ່ານ Principal-Axis
ວິທີການ
gn-direct-noscal - ການ​ແບ່ງ​ປັນ​ຮູບ​ສີ່​ແຈ​ສາກ (ບໍ່​ໄດ້​ຂະ​ຫຍາຍ​)
ld-tnewton-precond-restart - Preconditioned Truncated Newton ກັບ
restarting steepest-descent
ld-slsqp - ການດໍາເນີນໂຄງການສີ່ຫຼ່ຽມນ້ອຍສຸດຕາມລໍາດັບ

ຂັ້ນ​ຕອນ = 0; ສອງເທົ່າໃນ [0, inf)
ຂະ​ຫນາດ​ຂັ້ນ​ຕອນ​ຕົ້ນ​ສໍາ​ລັບ​ວິ​ທີ​ການ​ຟຣີ gradient​.

ຢຸດ = -inf; ສອງເທົ່າ
ເກນການຢຸດ: ຄ່າຟັງຊັນຕໍ່າກວ່າຄ່ານີ້.

xtola = 0; ສອງເທົ່າໃນ [0, inf)
ເກນການຢຸດເຊົາ: ການປ່ຽນແປງຢ່າງແທ້ຈິງຂອງຄ່າ x ທັງໝົດແມ່ນຢູ່ລຸ່ມນີ້
ມູນຄ່າ.

xtolr = 0; ສອງເທົ່າໃນ [0, inf)
ເກນການຢຸດເຊົາ: ການປ່ຽນແປງຂອງຄ່າ x ທັງໝົດແມ່ນຢູ່ລຸ່ມນີ້
ມູນຄ່າ.

EXAMPLE

ລົງທະບຽນຊຸດ perfusion ທີ່ໃຫ້ໄວ້ໃນ 'segment.set' ໂດຍໃຊ້ການປະເມີນ ICA ອັດຕະໂນມັດ.
ຂ້າມສອງຮູບໃນຕອນເລີ່ມຕົ້ນ ແລະຖ້າບໍ່ດັ່ງນັ້ນຈະໃຊ້ພາລາມິເຕີເລີ່ມຕົ້ນ. ເກັບຮັກສາ
ຜົນໄດ້ຮັບໃນ 'registered.set'.

mia-2dmyomilles -i segment.set -o register.set -k 2

ຜູ້ຂຽນ

Gert Wollny

COPYRIGHT

ຊອບແວນີ້ແມ່ນລິຂະສິດ (c) 1999-2015 Leipzig, ເຢຍລະມັນແລະ Madrid, ສະເປນ. ມັນມາ
ໂດຍບໍ່ມີການຮັບປະກັນຢ່າງແທ້ຈິງແລະທ່ານສາມາດແຈກຢາຍມັນຄືນໃຫມ່ພາຍໃຕ້ເງື່ອນໄຂຂອງ GNU
ໃບອະນຸຍາດສາທາລະນະທົ່ວໄປສະບັບ 3 (ຫຼືຫຼັງຈາກນັ້ນ). ສໍາລັບຂໍ້ມູນເພີ່ມເຕີມດໍາເນີນການໂຄງການທີ່ມີ
ທາງເລືອກ '--ລິຂະສິດ'.

ໃຊ້ mia-2dmyomilles ອອນໄລນ໌ໂດຍໃຊ້ບໍລິການ onworks.net